Package: sniffles (2.2-1)

[ Source: sniffles  ]

strumento per identificare varianti strutturali usando sequenziamento di terza generazione

Sniffles è uno strumento per identificare varianti strutturali (SV) usando dati di sequenziamento di terza generazione come quelli delle piattaforme Pacific Biosciences o Oxford Nanopore. Rileva tutti i tipi di SV usando allineamenti di letture divise, regioni con elevata non corrispondenza e analisi di copertura come indizi.

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• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-pysam

  interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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