Package: seqtk (1.4-2 and others)

[ Source: seqtk  ]

strumento veloce e leggero per elaborare sequenze in formato FASTA o FASTQ

Attualmente, seqtk gestisce il taglio basato sulla qualità con l'algoritmo phred, convertendo fastq in fasta, sequenze complementari inverse, l'estrazione o il mascheramento di sottosequenze in regioni date in un file BED/elenco di nomi e altro. Contiene un modulo di sottocampionamento per campionare esattamente n sequenze o una frazione di sequenze.

seqtk gestisce file di input sia fasta sia fastq, che possono opzionalmente essere compressi con gzip.

Other Packages Related to seqtk

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download seqtk

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.4-2	33.4 kB	152.0 kB	[list of files]
amd64	1.4-2	33.8 kB	95.0 kB	[list of files]
arm64	1.4-2	31.5 kB	87.0 kB	[list of files]
armel	1.4-2	32.3 kB	91.0 kB	[list of files]
armhf	1.4-2	32.0 kB	71.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.4-2	34.2 kB	91.0 kB	[list of files]
i386	1.4-2	37.3 kB	103.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.4-2	44.4 kB	155.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.4-2	30.8 kB	87.0 kB	[list of files]
mips64el	1.4-2	32.1 kB	154.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.4-2	36.4 kB	151.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.4-2	37.2 kB	151.0 kB	[list of files]
riscv64	1.4-2+b1	34.7 kB	80.0 kB	[list of files]
s390x	1.4-2	33.9 kB	95.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.4-2	37.0 kB	87.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.4-2	30.3 kB	1,049.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.4-2	33.7 kB	91.0 kB	[list of files]