Package: gromacs-openmpi (2020.5-4) [debports]

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simulatore di dinamica molecolare, binari per parallelizzazione OpenMPI

GROMACS è un pacchetto versatile per l'esecuzione di dinamiche molecolari, ovvero simulazioni delle equazioni newtoniane del moto per sistemi con un numero di particelle tra le centinaia e i milioni.

Progettato principalmente per biomolecole come proteine e lipidi con molte complesse interazioni di legame, GROMACS, essendo estremamente veloce nei calcoli per le interazioni di non-legame (che solitamente dominano le simulazioni) è anche utilizzato da molti gruppi per ricerche su sistemi non biologici, come ad esempio polimeri.

Questo pacchetto contiene solamente il motore principale di simulazione con gestione parallela usando l'interfaccia OpenMPI. È adatto per i nodi di un cluster di elaborazione o per macchine multiprocessore.

Other Packages Related to gromacs-openmpi

• dep: libc6.1 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  libreria per calcolare la trasformata di Fourier veloce (FFT) - precisione doppia

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  libreria per calcolare la trasformata di Fourier veloce (FFT) - precisione singola

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libhwloc15 (>= 2.4.1~rc3+dfsg)

  vista gerarchica della macchina - librerie condivise

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.0)

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libstdc++6 (>= 6)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: openmpi-bin (>= 1.2.3)

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni -- binari

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  libreria di compressione - runtime

• rec: gromacs

  simulatore di dinamica molecolare, con strumenti di costruzione e di analisi

• sug: gromacs-data

  GROMACS simulatore di dinamica molecolare, dati e documentazione

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