Package: dialign-tx (1.0.2-15)

[ Source: dialign-t  ]

allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti

DIALIGN-TX è uno strumento a riga di comando per fare allineamenti multipli di sequenze proteiche o di DNA. È una completa reimplementazione dell'approccio basato su segmenti che include diverse nuove migliorie e modelli euristici che migliorano significativamente la qualità degli allineamenti in output rispetto a DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Per l'allineamento di coppie, DIALIGN-TX usa un algoritmo di concatenazione dei frammenti che favorisce catene di allineamenti locali a basso punteggio rispetto a frammenti isolati ad alto punteggio. Per gli allineamenti multipli, DIALIGN-TX usa una procedura migliorata che è meno sensibile a somiglianze spurie tra sequenze locali.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-15)

  allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti (file dei dati)

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• enh: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

Download dialign-tx

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	104.2 kB	275.0 kB	[list of files]
amd64	85.5 kB	223.0 kB	[list of files]
arm64	89.3 kB	210.0 kB	[list of files]
armel	75.1 kB	198.0 kB	[list of files]
armhf	66.8 kB	142.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	95.7 kB	211.0 kB	[list of files]
i386	79.5 kB	210.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	151.4 kB	447.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	66.0 kB	194.0 kB	[list of files]
mips64el	99.9 kB	278.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	93.3 kB	275.0 kB	[list of files]
ppc64el	93.0 kB	275.0 kB	[list of files]
riscv64	106.1 kB	187.0 kB	[list of files]
s390x	73.6 kB	202.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	91.8 kB	210.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	84.4 kB	1,044.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	82.1 kB	206.0 kB	[list of files]