Package: bppsuite (2.4.1-7)

[ Source: bppsuite  ]

suite di programmi Bio++

La suite di programmi Bio++ è un pacchetto di programmi che usano le librerie Bio++ e che sono dedicati alla filogenetica e all'evoluzione molecolare. Tutti i programmi sono indipendenti, ma possono essere combinati per eseguire analisi piuttosto complesse. Questi programmi usano gli strumenti ausiliari di interfaccia delle librerie e perciò condividono la stessa sintassi. Hanno anche svariate opzioni in comune che possono essere condivise da software di terze parti.

Include i programmi:

 - BppML per analisi di massima verosimiglianza,
 - BppSeqGen per simulazione di sequenze,
 - BppAncestor per ricostruzione di stati ancestrali,
 - BppDist per metodi di distanza,
 - BppPars per analisi di parsimonia,
 - BppSeqMan per conversioni di file e manipolazione di sequenze,
 - BppConsense per costruire alberi di consenso e calcolare valori di
   bootstrap,
 - BppReRoot per cambiamento degli elementi radice dell'albero,
 - BppTreeDraw per disegnare alberi,
 - BppAlnScore per confrontare allineamenti e calcolare punteggi di
   allineamento,
 - BppMixedLikelihoods per calcolare verosimiglianze sito per sito
   di componenti di modelli mistura,
 - BppPopGen per analisi di genetica di popolazione.

Other Packages Related to bppsuite

• dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

  libreria principale di Bio++

• dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

  libreria filogenetica di Bio++

• dep: libbpp-popgen8t64 (>= 2.4.1)

  libreria per genetica di popolazione di Bio++

• dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

  libreria per sequenze di Bio++

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

• sug: bppsuite-examples

  esempi per la suite di programmi Bio++

Download bppsuite

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	372.9 kB	2,439.0 kB	[list of files]
amd64	379.9 kB	2,002.0 kB	[list of files]
arm64	354.2 kB	2,422.0 kB	[list of files]
armel	321.6 kB	1,606.0 kB	[list of files]
armhf	328.6 kB	1,326.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	391.4 kB	2,024.0 kB	[list of files]
i386	386.4 kB	1,830.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	386.9 kB	2,965.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	367.7 kB	1,794.0 kB	[list of files]
mips64el	346.9 kB	2,606.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	380.2 kB	2,806.0 kB	[list of files]
ppc64el	376.2 kB	2,614.0 kB	[list of files]
riscv64	363.1 kB	1,670.0 kB	[list of files]
s390x	359.2 kB	1,994.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	402.9 kB	2,166.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	332.2 kB	12,453.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	377.5 kB	1,742.0 kB	[list of files]