Package: velvet-tests (1.2.10+dfsg1-8)

[ Source: velvet  ]

dati di test per l'assemblatore di sequenze Velvet

Velvet è un assemblatore genomico de novo progettato specificatamente per le tecnologie di sequenziamento basate su sequenze corte, come Solexa o 454, sviluppato da Daniel Zerbino e Ewan Birney all'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), vicino a Cambridge, in Gran Bretagna.

Velvet attualmente accetta sequenze molto corte, rimuove errori e poi produce frammenti contigui unici di alta qualità. Poi usa informazioni sulle paired-read, se disponibili, per recuperare le aree ripetute tra i vari frammenti contigui.

Questo pacchetto contiene i dati di test per eseguire i test di unità di Velvet, un assemblatore genomico de novo, che possono essere usati come insieme aggiuntivo di esempi.

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