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Package: murasaki-mpi (1.68.6-8 and others) [debports]

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strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti (versione MPI)

Murasaki è uno strumento per la rilevazione di omologie in più genomi vasti veloce e basato sulla teoria del linguaggio. Permette allineamenti globali multipli di genomi su scala di intero genoma. Gestisce modelli di lunghezza illimitata con gap e seed e filtraggio unico basato su TF-IDF.

Murasaki è un software per allineamento ad ancore, che è

 * estremamente veloce (17 ore di CPU per l'intero genoma uomo x topo (con
   40 nodi: 52 minuti di orologio))
 * scalabile (parallelizzabile a piacimento tra più nodi usando MPI. Anche
   un singolo nodo con 16 GB di RAM può gestire più di 1 Gpb di sequenza.)
 * con lunghezza illimitata dei modelli
 * tollerante alle ripetizioni
 * con riduzione intelligente del rumore

Questo pacchetto fornisce il binario con gestione di MPI per murasaki. Mentre questo pacchetto velocizza le operazioni su macchine con più processori, rallenta quelle con un singolo processore.

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riscv64 (unofficial port) 1.68.6-8+b1 565.6 kB3,350.0 kB [list of files]