Package: python3-biom-format (2.1.15.2-3 and others)
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Debian Resources:
Download Source Package python-biom-format:
- [python-biom-format_2.1.15.2-3.dsc]
- [python-biom-format_2.1.15.2.orig.tar.gz]
- [python-biom-format_2.1.15.2-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [biom-format.org]
Similar packages:
formato BIOM (Biological Observation Matrix) (Python 3)
Il formato di file BIOM (Biological Observation Matrix, matrice di osservazioni biologiche) è progettato per essere un formato di uso generico per rappresentare campioni biologici con tabelle di contingenza delle osservazioni. BIOM è uno standard riconosciuto per l'Earth Microbiome Project ed è un progetto candidato del Genomics Standards Consortium.
Il formato BIOM è progettato per l'uso generico in vaste aree delle scienze -omiche comparative. Per esempio, in indagini su geni marker, l'uso principale di questo formato è quello di rappresentare tabelle OTU: in questo caso le osservazioni sono OTU e la matrice contiene i conteggi corrispondenti al numero di volte che ogni singola OTU è stata osservata in ciascun campione. Nel caso di dati di metagenomi, questo formato può essere usato per rappresentare tabelle metagenomiche: le osservazioni in questo caso potrebbero corrispondere ai sottosistemi SEED e la matrice conterrebbe i conteggi corrispondenti al numero di volte che ogni sottosistema è stato osservato in ciascun metagenoma. Analogamente, nel caso di dati genomici, questo formato può essere usato per rappresentare un insieme di genomi: le osservazioni in questo caso corrisponderebbero ancora una volta ai sottosistemi SEED e i conteggi corrisponderebbero al numero di volte che ogni sottosistema è stato osservato in ciascun genoma.
Questo pacchetto fornisce la libreria per il formato BIOM per l'interprete Python 3.
Other Packages Related to python3-biom-format
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- dep: cython3 [hppa, x32]
- C-Extensions for Python 3
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- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
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- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
- dep: python3 (<< 3.12) [hppa]
- dep: python3 (<< 3.13) [not hppa, x32]
- dep: python3 (<< 3.9) [x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [not x32]
- dep: python3 (>= 3.8~) [x32]
-
- dep: python3-click
- wrapper di optparse per utilità a riga di comando - Python 3.x
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- dep: python3-future [x32]
- compatibilità pulita con Python 3 e 2 in un singolo sorgente - Python 3.x
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- dep: python3-h5py
- interfaccia Python di uso generico per hdf5
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [x32]
- veloce funzionalità per array per il linguaggio Python (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [not sparc64, x32]
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [sparc64]
-
- dep: python3-numpy-abi9
- virtual package provided by python3-numpy
-
- dep: python3-pandas
- strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"
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- dep: python3-scipy
- strumenti scientifici per Python 3
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- dep: python3-six (>= 1.10.0) [x32]
- libreria di compatibilità per Python 2 e 3
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- sug: python-biom-format-doc
- documentazione del formato BIOM
Download python3-biom-format
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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alpha (unofficial port) | 2.1.15.2-2 | 171.0 kB | 1,293.0 kB | [list of files] |
amd64 | 2.1.15.2-3 | 177.3 kB | 1,107.0 kB | [list of files] |
arm64 | 2.1.15.2-3 | 162.8 kB | 1,219.0 kB | [list of files] |
hppa (unofficial port) | 2.1.12-3+b1 | 124.3 kB | 726.0 kB | [list of files] |
m68k (unofficial port) | 2.1.15.2-3 | 162.7 kB | 896.0 kB | [list of files] |
mips64el | 2.1.15.2-3 | 163.2 kB | 1,303.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 2.1.15.2-2 | 172.9 kB | 1,411.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 2.1.15.2-3 | 173.8 kB | 1,411.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 2.1.15.2-3 | 176.3 kB | 999.0 kB | [list of files] |
s390x | 2.1.15.2-3 | 174.9 kB | 1,111.0 kB | [list of files] |
sh4 (unofficial port) | 2.1.15.2-3 | 187.2 kB | 1,024.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 2.1.15.2-3 | 157.9 kB | 6,807.0 kB | [list of files] |
x32 (unofficial port) | 2.1.8+dfsg-3 | 136.8 kB | 733.0 kB | [list of files] |