Package: python3-mappy (2.27+dfsg-1 and others)

[ Source: minimap2  ]

interfaccia Python 3 per minimap2

Minimap2 è un versatile programma per l'allineamento di sequenze che allinea sequenze di DNA o mRNA rispetto a un grande database di riferimento. Casi d'uso tipici includono: (1) mappatura di letture genomiche PacBio o Oxford Nanopore con il genoma umano; (2) ricerca di sovrapposizioni tra letture lunghe con tassi di errore fino a ~15%; (3) allineamento, tenendo conto degli splice, di letture PacBio Iso-Seq o Nanopore cDNA o Direct RNA rispetto a un genoma di riferimento; (4) allineamento di letture Illumina singole o accoppiate; (5) allineamento assemblaggio-verso-assemblaggio; (6) allineamento dell'intero genoma tra due specie strettamente imparentate con divergenza sotto a ~15%.

Questo pacchetto contiene l'interfaccia Python 3 per usare minimap2.

Other Packages Related to python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.11) [x32]

  dep: python3 (<< 3.13) [not x32]

  dep: python3 (>= 3.10~) [x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [not x32]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

Download python3-mappy

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.26+dfsg-1	210.2 kB	956.0 kB	[list of files]
amd64	2.27+dfsg-1	175.9 kB	671.0 kB	[list of files]
arm64	2.27+dfsg-1	167.3 kB	695.0 kB	[list of files]
armel	2.27+dfsg-1	188.7 kB	777.0 kB	[list of files]
armhf	2.27+dfsg-1	190.7 kB	561.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.24+dfsg-3+b2	209.1 kB	867.0 kB	[list of files]
i386	2.27+dfsg-1	225.1 kB	985.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.24+dfsg-3+b1	256.8 kB	1,500.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.27+dfsg-1	187.0 kB	799.0 kB	[list of files]
mips64el	2.27+dfsg-1	195.8 kB	977.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1	215.4 kB	1,079.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.27+dfsg-1	200.1 kB	951.0 kB	[list of files]
riscv64	2.27+dfsg-1	222.9 kB	679.0 kB	[list of files]
s390x	2.27+dfsg-1	227.8 kB	955.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.24+dfsg-3+b2	233.3 kB	693.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1	183.0 kB	2,115.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.24+dfsg-2+b1	143.0 kB	341.0 kB	[list of files]