[ Source: debian-med ]
Package: med-bio-dev (3.8.1)
Links for med-bio-dev
Debian Resources:
Download Source Package debian-med:
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pacchetti Debian Med per lo sviluppo di applicazioni bioinformatiche
Questo metapacchetto installa pacchetti Debian che possono essere utili per lo sviluppo di applicazioni per la ricerca biologica.
Other Packages Related to med-bio-dev
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- dep: med-config (= 3.8.1)
- pacchetto Debian Med di configurazione generale
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- dep: med-tasks (= 3.8.1)
- task Debian Med per tasksel
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- rec: bio-tradis
- analizza l'output da analisi TraDIS di sequenze genomiche
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- rec: biobambam2
- strumenti per elaborare file di allineamento a livello iniziale
-
- rec: bioperl
- strumenti Perl per biologia molecolare computazionale
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- rec: bioperl-run
- wrapper BioPerl: script
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- rec: biosquid
- utilità per l'analisi di sequenze biologiche
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- rec: cwltool
- implementazione di riferimento di Common Workflow Language
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- rec: gffread
- conversioni di formati GFF/GTF, filtraggio di regioni, estrazione di sequenze FASTA
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- rec: goby-java
- next-generation sequencing data and results analysis tool
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- rec: libace-perl
- accesso orientato agli oggetti per i database ACEDB
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- rec: libai-fann-perl
- wrapper Perl per la libreria FANN
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- rec: libbambamc-dev
- Development files for reading and writing BAM (genome alignment) files
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- rec: libbamtools-dev
- API C++ per manipolare file BAM (allineamenti di genoma)
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- rec: libbigwig-dev
- libreria C per gestire file bigWig - file header
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- rec: libbio-alignio-stockholm-perl
- stockholm sequence input/output stream
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- rec: libbio-asn1-entrezgene-perl
- parser for NCBI Entrez Gene and NCBI Sequence records
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- rec: libbio-chado-schema-perl
- DBIx::Class layer for the Chado database schema
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- rec: libbio-cluster-perl
- moduli per cluster di BioPerl
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- rec: libbio-coordinate-perl
- moduli BioPerl per lavorare con coordinate biologiche
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- rec: libbio-das-lite-perl
- implementation of the BioDas protocol
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- rec: libbio-db-biofetch-perl
- Database object interface to BioFetch retrieval
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- rec: libbio-db-embl-perl
- Database object interface for EMBL entry retrieval
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- rec: libbio-db-hts-perl
- interfaccia Perl alla libreria HTS
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- rec: libbio-db-ncbihelper-perl
- collection of routines useful for queries to NCBI databases
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- rec: libbio-db-seqfeature-perl
- Normalized feature for use with Bio::DB::SeqFeature::Store
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- rec: libbio-eutilities-perl
- BioPerl interface to the Entrez Programming Utilities (E-utilities)
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- rec: libbio-featureio-perl
- Modules for reading, writing, and manipulating sequence features
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- rec: libbio-graphics-perl
- Generate GD images of Bio::Seq objects
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- rec: libbio-mage-perl
- Container module for classes in the MAGE package: MAGE
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- rec: libbio-mage-utils-perl
- Extra modules for classes in the MAGE package: MAGE
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- rec: libbio-primerdesigner-perl
- modulo Perl per progettare primer per PCR usando primer3 ed epcr
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- rec: libbio-samtools-perl
- interfaccia Perl alla libreria SamTools per sequenziamento di DNA
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- rec: libbio-scf-perl
- Perl extension for reading and writing SCF sequence files
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- rec: libbio-tools-phylo-paml-perl
- Bioperl interface to the PAML suite
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- rec: libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl
- interfaccia Bioperl a Clustal W
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- rec: libbio-tools-run-alignment-tcoffee-perl
- interfaccia Bioperl a T-Coffee
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- rec: libbio-tools-run-remoteblast-perl
- oggetto per l'esecuzione remota di NCBI Blast tramite HTTP
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- rec: libbio-variation-perl
- BioPerl variation-related functionality
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- rec: libbiococoa-dev
- infrastruttura per bioinformatica per GNUstep e Cocoa (file di sviluppo)
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- rec: libbiojava-java
- API Java per applicazioni e dati biologici (versione predefinita)
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- rec: libbiojava4-java
- API Java per applicazioni e dati biologici (versione predefinita)
also a virtual package provided by libbiojava4-java
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- rec: libbiojava6-java
- API Java per dati ed applicazioni biologiche (versione 6)
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- rec: libbioparser-dev
- library for parsing several formats in bioinformatics
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- rec: libblasr-dev
- strumenti per allineamento di letture PacBio su sequenze obiettivo (file di sviluppo)
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- rec: libbpp-core-dev
- file di sviluppo per la libreria principale di Bio++
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- rec: libbpp-phyl-dev
- file di sviluppo della libreria per filogenetica di Bio++
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- rec: libbpp-phyl-omics-dev
- libreria per filogenetica di Bio++: componenti genomici (file di sviluppo)
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- rec: libbpp-popgen-dev
- file di sviluppo della libreria per genetica di popolazione di Bio++
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- rec: libbpp-qt-dev
- file di sviluppo della libreria di classi grafiche Qt di Bio++
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- rec: libbpp-raa-dev
- file di sviluppo della libreria per accesso acnuc remoto di Bio++
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- rec: libbpp-seq-dev
- file di sviluppo della libreria per sequenze di Bio++
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- rec: libbpp-seq-omics-dev
- libreria per sequenze di Bio++: componenti genomiche (file di sviluppo)
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- rec: libcdk-java
- librerie Java Chemistry Development Kit (CDK)
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- rec: libchado-perl
- schema e strumenti per database per dati genomici
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- rec: libcifpp-dev
- file di sviluppo per libcifpp
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- rec: libconsensuscore-dev
- algoritmi per consenso di sequenze multiple per PacBio -- file di sviluppo
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- rec: libdivsufsort-dev
- libdivsufsort header files
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- rec: libedlib-dev
- libreria per allineamento di sequenze usando la distanza di modifica (sviluppo)
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- rec: libfast5-dev
- libreria per leggere file FAST5 di Oxford Nanopore -- header
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- rec: libfastahack-dev
- libreria per indicizzare ed estrarre sequenze da file FASTA (sviluppo)
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- rec: libffindex0-dev
- libreria per semplice indice/database per grandi quantità di piccoli file (sviluppo)
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- rec: libfml-dev
- development headers for libfml
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- rec: libgatbcore-dev
- libreria di sviluppo del toolbox di analisi genomica
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- rec: libgclib-dev
- header files for Genome Code Lib (GCLib)
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- rec: libgenome-dev
- toolkit per sviluppare software bioinformatico (sviluppo)
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- rec: libgenome-model-tools-music-perl
- module for finding mutations of significance in cancer
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- rec: libgenome-perl
- pipelines, tools, and data management for genomics
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- rec: libgenometools0-dev
- file di sviluppo per GenomeTools
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- rec: libgff-dev
- GFF/GTF parsing from cufflinks as a library
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- rec: libgkarrays-dev
- libreria per interrogare grandi collezioni di sequenze NGS (sviluppo)
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- rec: libgo-perl
- moduli Perl per GO e altre ontologie OBO
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- rec: libhdf5-dev
- HDF5 - file di sviluppo - versione seriale
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- rec: libhmsbeagle-dev
- libreria ad alte prestazioni per filogenetica bayesiana e a massima verosimiglianza (sviluppo)
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- rec: libhts-dev
- file di sviluppo per HTSlib
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- rec: libhtscodecs-dev
- Development headers for custom compression for CRAM and others
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- rec: libhtsjdk-java
- Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
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- rec: libjebl2-java
- Java Evolutionary Biology Library
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- rec: libjloda-java
- libreria Java di strutture dati e algoritmi per la bioinformatica
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- rec: libkmer-dev
- insieme di strumenti per l'analisi di sequenze di DNA (libreria di sviluppo)
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- rec: libmems-dev
- development library to support DNA string matching and comparative genomics
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- rec: libminimap2-dev
- header di sviluppo per libminimap
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- rec: libmuscle-dev
- libreria di sviluppo per allineamenti multipli di sequenze proteiche
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- rec: libncbi-vdb-dev
- librerie per usare dati in archivi di letture di sequenze INSDC (sviluppo)
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- rec: libncbi6-dev
- librerie NCBI per applicazioni biologiche (file di sviluppo)
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- rec: libncl-dev
- NEXUS Class Library (libreria statica e file header)
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- collegamenti a linguaggio per sequenziamento di prossima generazione (collegamenti Java)
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- rec: libnhgri-blastall-perl
- Perl extension for running and parsing NCBI's BLAST 2.x
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- rec: libopenmm-dev
- file header C++ per la libreria OpenMM
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- rec: libopenms-dev
- libreria per gestione ed analisi di dati LC/MS - file di sviluppo
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- rec: libpal-java
- Phylogenetic Analysis Library
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- rec: libparasail-dev
- Development heaaders and static libraries for parasail
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- rec: libpbbam-dev
- libreria per Binary Alignment/Map (BAM) di Pacific Biosciences (header)
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- rec: libpbdata-dev
- strumenti per gestire sequenze PacBio (file di sviluppo)
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- rec: libpbihdf-dev
- strumenti per gestire file hdf5 di PacBio (file di sviluppo)
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- rec: libpbseq-dev
- libreria per analizzare dati di sequenziamento PacBio (file di sviluppo)
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- rec: libpdb-redo-dev
- file di sviluppo per libpdb-redo
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- libreria per verosimiglianza filogenetica (sviluppo)
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- libreria per effettuare analisi di dati di proteomica (file di sviluppo)
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- libreria per analisi di sequenze di DNA -- sviluppo
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- rec: librcsb-core-wrapper0-dev
- development files for librcsb-core-wrapper0t64
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- rec: librdp-taxonomy-tree-java
- libreria per alberi tassonomici dal Ribosomal Database Project (RDP)
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- rec: librg-blast-parser-perl
- very fast NCBI BLAST parser - binding for Perl
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- rec: librg-reprof-bundle-perl
- protein secondary structure and accessibility predictor (perl module)
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- rec: librostlab-blast0-dev
- very fast C++ library for parsing the output of NCBI BLAST programs (devel)
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- rec: librostlab3-dev
- C++ library for computational biology (development)
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- rec: libsbml5-dev
- libreria System Biology Markup Language - file di sviluppo
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- rec: libseqan2-dev
- libreria C++ per l'analisi di sequenze biologiche (sviluppo)
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- rec: libseqan3-dev
- libreria C++ per l'analisi di sequenze biologiche v3 (sviluppo)
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- rec: libseqlib-dev
- C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data (dev)
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- rec: libslow5-dev
- header and static library for reading & writing SLOW5 files
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- rec: libsmithwaterman-dev
- determina regioni simili tra due stringhe o sequenze genomiche (sviluppo)
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- rec: libsnp-sites1-dev
- Static libraries and header files for the package snp-sites
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- rec: libsort-key-top-perl
- Perl module to select and sort top n elements of a list
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- rec: libspoa-dev
- SIMD partial order alignment library (development files)
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- rec: libsrf-dev
- implementazione C++ del formato SRF per dati di sequenze di DNA
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- rec: libssm-dev
- macromolecular superposition library - development files
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- rec: libssu-dev
- high-performance phylogenetic diversity calculations (dev)
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- rec: libssw-dev
- Development headers and static libraries for libssw
also a virtual package provided by libssw-dev
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- rec: libssw-java
- Java bindings for libssw
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- rec: libstaden-read-dev
- file di sviluppo per libstaden-read
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- rec: libstatgen-dev
- development files for the libStatGen
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- rec: libswiss-perl
- API Perl per il database UniProt
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- rec: libtabixpp-dev
- C++ wrapper to tabix indexer (development files)
also a virtual package provided by libtabixpp-dev
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- rec: libthread-pool-dev
- C++ header-only thread pool library (devel)
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- rec: libvcflib-dev
- libreria C++ per analizzare e manipolare file VCF (sviluppo)
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- rec: libvibrant6-dev
- librerie NCBI per applicazioni grafiche di biologia (file di sviluppo)
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- rec: libwfa2-dev
- exact gap-affine algorithm (development)
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- rec: libzerg-perl
- fast perl module for parsing the output of NCBI BLAST programs
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- rec: libzerg0-dev
- development libraries and header files for libzerg
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- rec: mcl
- algoritmo Cluster di Markov
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- wrapper per la libreria C hts
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- rec: nim-kexpr-dev
- espressioni matematiche kexpr per nim
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- rec: nim-lapper-dev
- simple, fast interval searches for nim
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- rec: ont-fast5-api
- simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format
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- rec: pyfai
- script per integrazione azimutale veloce
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- rec: python3-airr
- Data Representation Standard library for antibody and TCR sequences
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- rec: python3-anndata
- annotated gene by sample numpy matrix
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- rec: python3-bcbio-gff
- libreria Python 3 per leggere e scrivere Generic Feature Format
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- rec: python3-bioframe
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
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- rec: python3-biom-format
- formato BIOM (Biological Observation Matrix) (Python 3)
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- libreria per gestione del flusso di lavoro BioMAJ
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- libreria Python 3 per bioinformatica
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- utilità bioinformatiche per Python 3 per sequenziamento genomico ad alte prestazioni
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- library to manage genomic data and its alignment
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- rec: python3-cgecore
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- rec: python3-cigar
- manipulate SAM cigar strings
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- modellazione di reti biologiche basata su vincoli con Python 3
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- rec: python3-cogent3
- infrastruttura per biologia genomica
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- library for a sparse, compressed, binary persistent storage
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- libreria che esporta metodi di accesso C++ mmCIF in Python 3
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- infrastruttura Python per bioinformatica strutturale (versione Python3)
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- pulisce sequenze biologiche provenienti da letture di sequenziamento ad alte prestazioni (Python 3)
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- rec: python3-deeptools
- platform for exploring biological deep-sequencing data
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- rec: python3-deeptoolsintervals
- handlig GTF-like sequence-associated interal-annotation
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- libreria di calcolo filogenetico DendroPy (Python 3)
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- libreria Python 3 per analisi veloce di file FASTQ e FASTA
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- ambiente Python per esplorazione di alberi (filogenetici) - Python 3.X
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- rec: python3-fast5
- libreria per leggere file FAST5 di Oxford Nanopore -- Python 3
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- rec: python3-freecontact
- fast protein contact predictor - binding for Python3
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- flexible and extensible software library for handling sequence graphs
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- rec: python3-gffutils
- lavorare con file GFF e GTF in un'infrastruttura a database flessibile
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- parser for gene transfer format (aka GFF2)
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- utilità per analizzare letture di sequenziamento ad alta efficienza del genoma per Python 3
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- rec: python3-intervaltree-bio
- comode classi per alberi di intervalli per dati genomici -- libreria Python 3
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- rec: python3-kineticstools
- rilevazione di modifiche al DNA (libreria Python 3)
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- rec: python3-loompy
- access loom formatted files for bioinformatics
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- rec: python3-mirtop
- annotate miRNAs with a standard mirna/isomir naming (Python 3)
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- rec: python3-nanoget
- extract information from Oxford Nanopore sequencing data and alignments
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- rec: python3-ngs
- collegamenti a linguaggio per sequenziamento di prossima generazione (collegamenti Python 3)
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- rec: python3-pairix
- 1D/2D indexing and querying with a pair of genomic coordinates
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- rec: python3-pangolearn
- store of the trained model for pangolin to access
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- rec: python3-parasail
- Python3 bindings for the parasail C library
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- rec: python3-pbcommand
- interfaccia comune a riga di comando per moduli di analisi di Pacific Biosciences
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- rec: python3-pbconsensuscore
- algoritmi per consenso di sequenze multiple per PacBio -- Python 3
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- rec: python3-pbcore
- libreria Python 3 per elaborare file di dati PacBio
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- generate atomic oligopeptide 3D structure from sequence
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- rec: python3-presto
- toolkit per elaborare sequenze di cellule B e T (modulo Python 3)
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- rec: python3-propka
- calcoli euristici di pKa con ligandi (Python 3)
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- rec: python3-py2bit
- access to 2bit files
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- adaptive banded Partial Order Alignment - python3 module
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- Python3 module for average nucleotide identity analyses
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- wrapper in Python 3 intorno a BEDTools per lavori di bioinformatica
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- rec: python3-pybel
- linguaggio per espressioni biologiche
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- modulo Python 3 per veloce accesso a file bigBed e bigWig
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- accesso casuale efficiente per sottosequenze FASTA in Python 3
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- rec: python3-pyfastx
- fast random access to sequences from FASTA/Q file - python3 module
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- nanopore whole genome assembly (dynamic library)
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- strutture dati, algoritmi, risorse educative in Python 3 per bioinformatica
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- sug: conda-package-handling
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- minimal ANSI C thread pool - development files
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- sug: cwlformat
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- sug: libatomicqueue-dev
- Package not available
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- manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
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- sug: libbbhash-dev
- bloom-filter based minimal perfect hash function library
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- C++ header-only support library for bioinformatics tools
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- libreria di codice comune di Bioinformatics Technology Lab
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- packaging tool for Java applications with Maven coordinates
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- industrial-strength lock-free queue for C++
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- sug: libdisorder-dev
- libreria per la misura dell'entropia di flussi di byte (sviluppo)
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- Package not available
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- sug: libforester-java
- Package not available
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- sug: libfreecontact-dev
- fast protein contact predictor library - development files
also a virtual package provided by libfreecontact-dev
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- documentation for libfreecontact
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- sug: libfreecontact-perl
- fast protein contact predictor - binding for Perl
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- sug: libgatk-bwamem-java
- interfaccia per chiamare lo strumento di allineamento bwa mem di Heng Li da codice Java
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- sug: libgatk-bwamem-jni
- interfaccia per chiamare lo strumento di allineamento bwa mem di Heng Li da codice Java (jni)
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- sug: libgatk-fermilite-java
- interfaccia per chiamare l'assemblatore fermi-lite di Heng Li da codice Java
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- sug: libgatk-fermilite-jni
- interfaccia per chiamare l'assemblatore fermi-lite di Heng Li da codice Java (jni)
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- sug: libgatk-native-bindings-java
- libreria di collegamenti nativi per gatk e picard-tools
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- sug: libgenomicsdb-dev
- sparse array storage library for genomics (development files)
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- sug: libgenomicsdb-java
- sparse array storage library for genomics (Java library)
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- sug: libicb-utils-java
- Java library of utilities to manage files and compute statistics
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- sug: libmaus2-dev
- collection of data structures and algorithms for biobambam (devel)
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- sug: libmilib-java
- libreria per elaborazione di dati di Next Generation Sequencing (NGS)
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- sug: libminimap-dev
- header di sviluppo per libminimap
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- sug: libmmblib-dev
- Package not available
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- sug: libmodhmm-dev
- library for constructing, training and scoring hidden Markov models (dev)
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- sug: libnexml-java
- Package not available
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- sug: libngs-sdk-dev
- Package not available
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- sug: libpbcopper-dev
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications -- header files
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- sug: libqcpp-dev
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- sug: librelion-dev
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- sug: librostlab-blast-doc
- very fast C++ library for parsing the output of NCBI BLAST programs (doc)
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- sug: libsuma-dev
- headers and static library for sumatra and sumaclust
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- sug: libsvmloc-dev
- PSORTb adapted library for svm machine-learning library (dev)
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- enumerate terraces in phylogenetic tree space (development lib)
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- sug: libtfbs-perl
- scanning DNA sequence with a position weight matrix
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- sug: libvbz-hdf-plugin-dev
- VBZ compression plugin for nanopore signal data (devel)
-
- sug: libxxsds-dynamic-dev
- succinct and compressed fully-dynamic data structures library
-
- sug: octace-bioinfo
- Package not available
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- sug: python-biopython-doc
- documentazione per la libreria Biopython
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- sug: python3-alignlib
- distanze di edit e di Hamming per sequenze biologiche
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- sug: python3-bcbio
- libreria per analizzare dati di sequenziamento ad alte prestazioni
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- sug: python3-bel-resources
- utilità Python 3 per file di risorse BEL
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- sug: python3-bioblend
- libreria delle API di CloudMan e Galaxy (Python 3)
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- sug: python3-biopython-sql
- gestione dello schema di database BioSQL per Biopython (Python 3)
-
- sug: python3-cgelib
- codice Python 3 per essere utilizzato negli strumenti CGE
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- sug: python3-compclust
- Package not available
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- sug: python3-conda-package-streaming
- recupera metadati conda
-
- sug: python3-consensuscore2
- Package not available
-
- sug: python3-ctdopts
- conferisce agli strumenti Python un'interfaccia compatibile con CTD
-
- sug: python3-galaxy-lib
- Package not available
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- sug: python3-intake
- lightweight package for finding and investigating data
-
- sug: python3-joypy
- ridgeline-/joyplots plotting routine
-
- sug: python3-misopy
- Package not available
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- sug: python3-ncls
- datastructure for interval overlap queries
-
- sug: python3-networkx
- strumento per creare, manipolare e studiare reti complesse (Python 3)
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- sug: python3-pycosat
- collegamenti Python a picosat
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- sug: python3-pyflow
- leggero motore per compiti paralleli per Python
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- sug: python3-roadrunner
- Package not available
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- sug: python3-scanpy
- Package not available
-
- sug: python3-seqcluster
- analysis of small RNA in NGS data
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- sug: q2-alignment
- plugin di QIIME 2 per generare e manipolare allineamenti
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- sug: q2-composition
- Package not available
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- sug: q2-cutadapt
- plugin QIIME 2 per lavorare con adattatori in dati di sequenze
-
- sug: q2-dada2
- plugin QIIME 2 per lavorare con adattatori in dati di sequenze
-
- sug: q2-deblur
- Package not available
-
- sug: q2-demux
- plugin QIIME 2 fare il demultiplexing delle letture di sequenze
-
- sug: q2-diversity
- Package not available
-
- sug: q2-emperor
- plugin QIIME2 per visualizzazione di "ordination plot"
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- sug: q2-feature-classifier
- plugin QIIME 2 per gestione di classificazione tassonomica
-
- sug: q2-feature-table
- plugin QIIME 2 per gestione di operazioni su tabelle di caratteristiche
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- sug: q2-fragment-insertion
- plugin di QIIME 2 per inserzione di frammenti
-
- sug: q2-gneiss
- Package not available
-
- sug: q2-longitudinal
- Package not available
-
- sug: q2-metadata
- plugin per QIIME 2 per lavorare con Metadati e visualizzarli
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- sug: q2-phylogeny
- plugin QIIME 2 per filogenia
-
- sug: q2-quality-control
- plugin QIIME 2 per controllo qualità di dati di caratteristiche e sequenze
-
- sug: q2-quality-filter
- plugin QIIME 2 per filtraggio e taglio basato su PHRED
-
- sug: q2-sample-classifier
- plugin QIIME 2 per la predizione con apprendimento macchina di dati campionari
-
- sug: q2-shogun
- Package not available
-
- sug: q2-taxa
- plugin QIIME 2 per lavorare con annotazioni tassonomiche di caratteristiche
-
- sug: q2-types
- plugin QIIME 2 che definisce tipi per analisi di microbioma
-
- sug: q2-vsearch
- Package not available
-
- sug: q2cli
- interfaccia a riga di comando basata su clic per QIIME 2
-
- sug: q2cwl
- Package not available
-
- sug: q2lint
- Package not available
-
- sug: q2templates
- pacchetto per modello di struttura per plugin QIIME 2
-
- sug: qiime
- Quantitative Insights Into Microbial Ecology
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- sug: r-bioc-affxparser
- Affymetrix File Parsing SDK
-
- sug: r-bioc-affy
- metodi BioConductor per array di oligonucleotidi dell'Affymetrix
-
- sug: r-bioc-affyio
- strumenti BioConductor per analizzare file di dati Affymetrix
-
- sug: r-bioc-altcdfenvs
- ambienti CDF alternativi per BioConductor
-
- sug: r-bioc-annotate
- annotazioni BioConductor per microarray
-
- sug: r-bioc-annotationdbi
- GNU R Annotation Database Interface per BioConductor
-
- sug: r-bioc-annotationhub
- client GNU R per accedere a risorse AnnotationHug
-
- sug: r-bioc-aroma.light
- BioConductor methods normalization and visualization of microarray data
-
- sug: r-bioc-arrayexpress
- accesso al database di microarray ArrayExpress presso EBI
-
- sug: r-bioc-biocgenerics
- funzioni generiche per Bioconductor
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- sug: r-bioc-biocneighbors
- Nearest Neighbor Detection for Bioconductor Packages
-
- sug: r-bioc-biomart
- GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)
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- sug: r-bioc-biomformat
- pacchetto di interfaccia per GNU R per il formato di file BIOM
-
- sug: r-bioc-biostrings
- oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
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- sug: r-bioc-biovizbase
- utilità grafiche di base per GNU R per la visualizzazione di dati genomici
-
- sug: r-bioc-bitseq
- Package not available
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- sug: r-bioc-bridgedbr
- Package not available
-
- sug: r-bioc-bsgenome
- infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings
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- sug: r-bioc-cager
- Package not available
-
- sug: r-bioc-cner
- rilevazione e visualizzazione di CNE
-
- sug: r-bioc-complexheatmap
- creazione di mappe di calore complesse usando GNU R
-
- sug: r-bioc-ctc
- conversione di cluster e alberi (Cluster and Tree Conversion)
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- sug: r-bioc-cummerbund
- strumento per l'analisi dell'output RNA-Seq di Cufflinks
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- sug: r-bioc-dada2
- sample inference from amplicon sequencing data
-
- sug: r-bioc-deseq
- analisi dell'espressione differenziale di geni per GNU R
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- sug: r-bioc-deseq2
- pacchetto R per analisi RNA-Seq di espressione differenziale
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- sug: r-bioc-dnacopy
- R package: DNA copy number data analysis
-
- sug: r-bioc-ebseq
- pacchetto R per analisi RNA-Seq di espressione differenziale
-
- sug: r-bioc-enrichedheatmap
- Package not available
-
- sug: r-bioc-ensembldb
- utilità per GNU R per creare e usare un database di annotazioni basato su Ensembl
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- sug: r-bioc-genefilter
- metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray
-
- sug: r-bioc-geneplotter
- pacchetto R di funzioni per disegnare dati genomici
-
- sug: r-bioc-genomeinfodb
- utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi
-
- sug: r-bioc-genomicalignments
- rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor
-
- sug: r-bioc-genomicfeatures
- strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle
-
- sug: r-bioc-genomicranges
- rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor
-
- sug: r-bioc-geoquery
- ottiene dati da Gene Expression Omnibus (GEO) dell'NCBI
-
- sug: r-bioc-go.db
- annotation maps describing the entire Gene Ontology
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- sug: r-bioc-graph
- gestisce strutture di dati di grafi per BioConductor
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- sug: r-bioc-gseabase
- strutture dati e metodi per arricchimento di insiemi di geni
-
- sug: r-bioc-gsva
- Gene Set Variation Analysis for microarray and RNA-seq data
-
- sug: r-bioc-gviz
- disegno di dati e informazioni di annotazioni vicino a coordinate genomiche
-
- sug: r-bioc-hypergraph
- strutture di dati di ipergrafi per Bioconductor
-
- sug: r-bioc-impute
- imputazione per dati di microarray
-
- sug: r-bioc-iranges
- contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R
-
- sug: r-bioc-limma
- modelli lineari per dati di microarray
-
- sug: r-bioc-makecdfenv
- BioConductor CDF Environment Maker
-
- sug: r-bioc-mergeomics
- Integrative network analysis of omics data
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- sug: r-bioc-metagenomeseq
- analisi statistiche per GNU R per sequenziamento sparso ad alte prestazioni
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- sug: r-bioc-mofa
- Multi-Omics Factor Analysis (MOFA)
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- sug: r-bioc-multiassayexperiment
- Software for integrating multi-omics experiments in BioConductor
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- sug: r-bioc-nanostringqcpro
- Package not available
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- sug: r-bioc-oligo
- Preprocessing tools for oligonucleotide arrays
-
- sug: r-bioc-oligoclasses
- Classes for high-throughput arrays supported by oligo and crlmm
-
- sug: r-bioc-org.hs.eg.db
- annotazioni a livello di tutto genoma per l'Uomo
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- sug: r-bioc-pcamethods
- BioConductor collection of PCA methods
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- sug: r-bioc-phyloseq
- gestione ed analisi per GNU R di dati di censimenti di microbiomi ad alte prestazioni
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- sug: r-bioc-preprocesscore
- raccolta di funzioni di pre-elaborazione per BioConductor
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- sug: r-bioc-purecn
- copy number calling and SNV classification using targeted short read sequencing
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- sug: r-bioc-qusage
- qusage: Quantitative Set Analysis for Gene Expression
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- sug: r-bioc-rbgl
- interfaccia R agli algoritmi per grafi contenuti nella libreria BOOST
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- sug: r-bioc-rentrez
- Package not available
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- sug: r-bioc-rsamtools
- allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R
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- sug: r-bioc-rtracklayer
- interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione
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- sug: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- sug: r-bioc-savr
- analisi di file SAV di Illumina per GNU R
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- sug: r-bioc-shortread
- classi e metodi GNU R per grosse moli di dati di sequenziamento short-read
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- sug: r-bioc-snpstats
- classi e metodi SnpMatrix e XSnpMatrix per BioConductor
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- sug: r-bioc-structuralvariantannotation
- Variant annotations for structural variants
-
- sug: r-bioc-tfbstools
- GNU R Transcription Factor Binding Site (TFBS) Analysis
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- sug: r-bioc-titancna
- Subclonal copy number and LOH prediction from whole genome sequencing
-
- sug: r-bioc-tximport
- transcript-level estimates for biological sequencing
-
- sug: r-bioc-variantannotation
- annotazione di varianti genetiche per BioConductor
-
- sug: r-bioc-xvector
- rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor
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- sug: r-cran-adegenet
- analisi esplorative di GNU R per dati genetici e genomici
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- sug: r-cran-adephylo
- analisi esplorative per GNU R per il metodo di confronto filogenetico
-
- sug: r-cran-amap
- un altro pacchetto di analisi multidimensionale
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- sug: r-cran-biwt
- biweight mean vector and covariance and correlation
-
- sug: r-cran-drinsight
- Package not available
-
- sug: r-cran-dt
- wrapper GNU R della libreria JavaScript "DataTables"
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- sug: r-cran-dynamictreecut
- Methods for Detection of Clusters in Hierarchical Clustering
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- sug: r-cran-fastcluster
- funzioni veloci di raggruppamento in cluster gerarchico per GNU R
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- sug: r-cran-future.apply
- apply function to elements in parallel using futures
-
- sug: r-cran-future.batchtools
- Future API for Parallel and Distributed Processing
-
- sug: r-cran-ica
- Independent Component Analysis
-
- sug: r-cran-itertools
- strumenti per iteratori
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- sug: r-cran-kaos
- Encoding of Sequences Based on Frequency Matrix Chaos
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- sug: r-cran-metap
- Meta-Analysis of Significance Values
-
- sug: r-cran-minerva
- Maximal Information-Based Nonparametric Exploration
-
- sug: r-cran-natserv
- interfaccia GNU R a "NatureServe"
-
- sug: r-cran-nmf
- GNU R framework to perform non-negative matrix factorization
-
- sug: r-cran-optimalcutpoints
- calcolo dei punti di cut-off ottimali in test diagnostici
-
- sug: r-cran-parmigene
- Parallel Mutual Information to establish Gene Networks
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- sug: r-cran-pcapp
- Robust PCA by Projection Pursuit
-
- sug: r-cran-proc
- Display and Analyze ROC Curves
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- sug: r-cran-rann
- Fast Nearest Neighbour Search Using L2 Metric
-
- sug: r-cran-rcpphnsw
- R bindings for a Library for Approximate Nearest Neighbors
-
- sug: r-cran-robustrankaggreg
- metodi per robusta aggregazione di ranghi
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- sug: r-cran-rocr
- pacchetto GNU R per preparare e visualizzare curve ROC
-
- sug: r-cran-rook
- web server interface for R
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- sug: r-cran-rsvd
- Randomized Singular Value Decomposition
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- sug: r-cran-shazam
- Immunoglobulin Somatic Hypermutation Analysis
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- sug: r-cran-sitmo
- GNU R parallel pseudo random number generator 'sitmo' header files
-
- sug: r-cran-venndiagram
- genera diagrammi di Venn e Eulero ad alta risoluzione
-
- sug: r-other-apmswapp
- Package not available
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- sug: ruby-rgfa
- parse, edit and write GFA format graphs in Ruby
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- sug: vdjtools
- framework for post-analysis of B/T cell repertoires
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