Package: fastlink (4.1P-fix100+dfsg-5)

[ Source: fastlink  ]

versione più veloce dei programmi di Linkage per pedigree

L'analisi di linkage è una tecnica statistica usata per mappare geni e trovare la posizione approssimata di geni responsabili di malattie. Per le analisi di linkage esisteva un pacchetto software standard chiamato LINKAGE. FASTLINK è una versione fortemente modificata e migliorata del programma principale di LINKAGE che gira molto più velocemente in modo sequenziale, può essere eseguita in parallelo, permette all'utente di ripartire facilmente se il computer va in crash e fornisce abbondante documentazione nuova. FASTLINK è stato usato in più di 1000 studi genetici di linkage pubblicati.

Questo pacchetto contiene i seguenti programmi:

 ilink:    procedura di ottimizzazione GEMINI per trovare un valore locale
           ottimale per il vettore theta delle frazioni di ricombinazione;
 linkmap:  calcola i punteggi delle posizioni di un locus rispetto a una
           mappa fissata di altri loci;
 lodscore: compara la verosimiglianza corrispondente al theta locale
           ottimale;
 mlink:    calcola i punteggi LOD e il rischio con due o più loci;
 unknown:  identifica possibili genotipi per sconosciuti.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Need an extra tag, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to fastlink

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: fastlink-doc

  alcuni documenti su fastlink

Download fastlink

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	234.0 kB	1,035.0 kB	[list of files]
amd64	250.3 kB	859.0 kB	[list of files]
arm64	235.0 kB	1,035.0 kB	[list of files]
armel	238.8 kB	922.0 kB	[list of files]
armhf	226.2 kB	662.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	223.4 kB	795.0 kB	[list of files]
i386	248.1 kB	902.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	287.9 kB	1,614.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	228.6 kB	822.0 kB	[list of files]
mips64el	237.9 kB	1,067.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	253.3 kB	1,227.0 kB	[list of files]
ppc64el	253.7 kB	1,099.0 kB	[list of files]
riscv64	267.5 kB	795.0 kB	[list of files]
s390x	281.7 kB	1,083.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	265.1 kB	1,034.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	229.6 kB	5,264.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	245.4 kB	806.0 kB	[list of files]