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Package: canu (1.8+dfsg-1 and others)

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assemblatore di sequenze di molecole singole per genomi

Canu è un fork di Celera Assembler, progettato per sequenziamento con alto rumore di molecole singole (come PacBio RS II o Oxford Nanopore MinION).

Canu è una catena pipe di assemblaggio gerarchico che viene eseguita in quattro passi:

 * rilevamento di sovrapposizioni in sequenze con alto rumore usando MHAP;
 * generazione del consenso delle sequenze corrette;
 * taglio delle sequenze corrette;
 * assemblaggio delle sequenze corrette dopo il taglio.

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Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 1.8+dfsg-1 1,971.3 kB12,736.0 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 1.6+dfsg-1 1,701.9 kB11,292.0 kB [list of files]
powerpcspe (unofficial port) 1.6+dfsg-1 1,934.5 kB13,927.0 kB [list of files]
ppc64 (unofficial port) 1.6+dfsg-1 1,985.7 kB15,043.0 kB [list of files]
sh4 (unofficial port) 1.6+dfsg-1 1,989.5 kB10,115.0 kB [list of files]
sparc64 (unofficial port) 1.6+dfsg-1 1,665.0 kB11,879.0 kB [list of files]