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[ Source: canu ]
Package: canu (1.8+dfsg-2 and others)
Links for canu
Debian Resources:
Download Source Package canu:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [canu.readthedocs.org]
Similar packages:
assemblatore di sequenze di molecole singole per genomi
Canu è un fork di Celera Assembler, progettato per sequenziamento con alto rumore di molecole singole (come PacBio RS II o Oxford Nanopore MinION).
Canu è una catena pipe di assemblaggio gerarchico che viene eseguita in quattro passi:
* rilevamento di sovrapposizioni in sequenze con alto rumore usando MHAP; * generazione del consenso delle sequenze corrette; * taglio delle sequenze corrette; * assemblaggio delle sequenze corrette dopo il taglio.
Other Packages Related to canu
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- dep: gnuplot [amd64]
- programma a riga di comando interattivo per tracciare grafici
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
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- dep: libc6 (>= 2.24) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, sparc64]
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
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- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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- rec: gnuplot
- programma a riga di comando interattivo per tracciare grafici
also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- sug: nanopolish
- identificatore di sequenze di consenso per dati di sequenziamento a nanopori
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- sug: pbgenomicconsensus
- strumento di Pacific Biosciences per identificare varianti e consenso
Download canu
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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amd64 | 1.8+dfsg-2 | 1,971.5 kB | 12,736.0 kB | [list of files] |
m68k (unofficial port) | 1.6+dfsg-1 | 1,701.9 kB | 11,292.0 kB | [list of files] |
powerpcspe (unofficial port) | 1.6+dfsg-1 | 1,934.5 kB | 13,927.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 1.6+dfsg-1 | 1,985.7 kB | 15,043.0 kB | [list of files] |
sh4 (unofficial port) | 1.6+dfsg-1 | 1,989.5 kB | 10,115.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 1.6+dfsg-1 | 1,665.0 kB | 11,879.0 kB | [list of files] |