Package: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 and others)

[ Source: seqtools  ]

navigatore interattivo di allineamenti di sequenze

Blixem è un navigatore interattivo di allineamenti di sequenze che sono state impilate in un allineamento multiplo "master-slave"; non è un "vero" allineamento multiplo, ma un allineamento "uno-a-molti".

 * sezione panoramica che mostra le posizioni di geni e allineamenti
   intorno alla finestra di allineamento;
 * sezione dettagliata che mostra l'allineamento effettivo di sequenze
   di proteine o nucleotidi alla sequenza di DNA genomico;
 * visualizzazione di allineamenti rispetto ad entrambi i filamenti della
   sequenza di riferimento;
 * visualizzazione di sequenze in modalità nucleotidi o proteina: in
   modalità proteina, Blixem mostrerà la traduzione a 3 frame della
   sequenza di riferimento;
 * i residui sono evidenziati in colori differenti se sono una
   corrispondenza esatta, una sostituzione conservativa o una mancata
   corrispondenza;
 * sono gestiti allineamenti con gap, con inserzioni e delezioni
   evidenziate nella sequenza corrispondente;
 * le corrispondenze possono essere ordinate e filtrate;
 * SNP e altre variazioni possono essere evidenziate nella sequenza di
   riferimento;
 * le code poli(A) possono essere visualizzate e i segnali poli(A)
   evidenziati nella sequenza di riferimento.

Tags: Interface Toolkit: GTK

Other Packages Related to blixem

• dep: libatk1.0-0t64 (>= 1.12.4) [sparc64]

  toolkit per l'accessibilità ATK

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  libreria Cairo per grafica 2D vettoriale

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione OpenSSL)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [not alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione OpenSSL)

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6) [sparc64]

  libreria generica di configurazione di tipi di carattere - runtime

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

  motore per caratteri FreeType 2, libreria condivisa

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  libreria per visualizzare allineamenti di sequenze

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0) [sparc64]

  libreria GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)

  libreria GLib di routine in C

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.14.0) [alpha, sparc64]

  libreria per interfacce utente grafiche GTK - vecchia versione

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0) [not alpha, sparc64]

  libreria per interfacce utente grafiche GTK - vecchia versione

• dep: libharfbuzz0b (>= 0.6.0) [sparc64]

  motore delle forme per testi OpenType (libreria condivisa)

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [sparc64]

  libreria per leggere e scrivere JSON per C++

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  impaginazione e rendering di testo internazionalizzato

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  impaginazione e rendering di testo internazionalizzato

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  impaginazione e rendering di testo internazionalizzato

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  libreria condivisa SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

Download blixem

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,327.0 kB	2,429.0 kB	[list of files]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,347.5 kB	2,220.0 kB	[list of files]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,314.2 kB	2,290.0 kB	[list of files]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,292.4 kB	2,060.0 kB	[list of files]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,298.9 kB	1,820.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,333.3 kB	2,197.0 kB	[list of files]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,360.8 kB	2,356.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,378.9 kB	3,243.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,339.1 kB	2,245.0 kB	[list of files]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,340.2 kB	2,634.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,346.7 kB	2,675.0 kB	[list of files]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,346.5 kB	2,548.0 kB	[list of files]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,340.1 kB	2,020.0 kB	[list of files]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,322.3 kB	2,266.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,361.6 kB	2,227.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,295.2 kB	3,224.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,348.7 kB	2,155.0 kB	[list of files]