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Package: anfo (0.98-7 and others)

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strumento per allineare/mappare letture corte da MPG

Anfo è uno strumento per mappatura nello spirito di Soap/Maq/Bowtie, ma la sua implementazione assomiglia più a BLAST/BLAT. È utile soprattutto per l'allineamento di letture di sequenze in cui la sequenza di DNA è in qualche modo modificata (si pensi a DNA ancestrale o a trattamento con bisolfito) o c'è più divergenza tra il campione e il riferimento di quanta viene gestita bene dai mappatori veloci (ad esempio il genoma di riferimento è mancante e viene usata invece una specie correlata).

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alpha (unofficial port) 0.98-7 115.7 kB468.0 kB [list of files]
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hppa (unofficial port) 0.98-7 118.6 kB409.0 kB [list of files]
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riscv64 (unofficial port) 0.98-7+b2 113.9 kB377.0 kB [list of files]
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sh4 (unofficial port) 0.98-7 132.7 kB400.0 kB [list of files]
sparc64 (unofficial port) 0.98-7 103.1 kB441.0 kB [list of files]
x32 (unofficial port) 0.98-7 116.8 kB404.0 kB [list of files]