Package: python-pbgenomicconsensus (2.3.2-5)

[ Source: pbgenomicconsensus  ]

strumento di Pacific Biosciences per identificare varianti e consenso (Python 2)

Il pacchetto GenomicConsensus fornisce Quiver: lo strumento per identificare varianti e consenso che è l'ammiraglia di Pacific Biosciences. Quiver è un algoritmo che trova la sequenza modello con massima verosimiglianza date le letture PacBio del modello. Queste letture sono modellate usando un approccio a campo casuale condizionale che assegna una probabilità ad una lettura data una sequenza modello. In aggiunta alla sequenza di basi di ogni lettura, Quiver utilizza diverse covariate aggiuntive per valore di qualità che vengono fornite dallo strumento di identificazione delle basi.

Questo pacchetto fa parte della suite SMRTAnalysis e fornisce la libreria backend per Python 2.

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• dep: python-pbcore

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