Package: hinge (0.5.0-4)

[ Source: hinge  ]

assemblatore di letture lunghe del genoma basato su hinging

HINGE è un assemblatore di genoma che cerca di ottenere una risoluzione ottimale delle ripetizioni distinguendo le ripetizioni che possono essere risolte sulla base dei dati, da quelle che non possono esserlo. Ciò è ottenuto aggiungendo "cerniere" alle letture per costruire un grafo di sovrapposizioni nel quale solo le ripetizioni irrisolvibili sono fuse. Come risultato, HINGE combina la resilienza agli errori degli assemblatori basati sulle sovrapposizioni con le capacità di risoluzione delle ripetizioni degli assemblatori di grafi de Bruijn.

Other Packages Related to hinge

• dep: daligner

  rilevazione di allineamenti locali tra letture lunghe di sequenze nucleotidiche

• dep: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• dep: dazzdb

  gestione dei dati di letture di sequenziamento di nucleotidi

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:4.5) [arm64]

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

• dep: python-colormap

  ease manipulation of matplotlib colormaps and color codecs (Python 2)

• dep: python-configparser

  backport dell'analizzatore di configurazione migliorato introdotto con Python 3.2

• dep: python-matplotlib

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab

• dep: python-networkx

  strumento per creare, manipolare e studiare reti complesse

• dep: python-numpy

  aggiunge una veloce struttura per array al linguaggio Python

• dep: python-pbcore

  libreria Python 2 per elaborare file di dati PacBio

• dep: python-ujson

  velocissimo codificatore e decodificatore JSON per Python 2

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	421.7 kB	2,790.0 kB	[list of files]
arm64	384.3 kB	2,646.0 kB	[list of files]