Package: r-cran-surveillance (1.16.2-1)

[ Source: r-cran-surveillance  ]

pacchetto GNU R per la modellazione e il monitoraggio di fenomeni epidemici

Implementazione di metodi statistici per la modellazione e la rilevazione del punto di cambiamento in serie temporali di conteggi, proporzioni e dati categorici, così come per la modellazione di fenomeni epidemici nel tempo continuo, ad esempio configurazioni a spazio discreto come i modelli SEIR (Susceptible-Exposed-Infectious-Recovered) spazialmente arricchiti o dati di processi puntuali nello spazio continuo come l'occorrenza di malattie infettive. Lo scopo principale è la rilevazione dell'insorgenza di epidemie in serie temporali di conteggi provenienti dai sistemi di sorveglianza della salute pubblica per le malattie trasmissibili, ma potrebbero esserci applicazioni anche nei campi dell'environmetrica, dell'ingegneria dell'affidabilità, dell'econometria o delle scienze sociali.

Attualmente il pacchetto contiene le implementazioni di molte comuni procedure di rilevamento dell'insorgenza di epidemie, come Farrington et al. (1996), Noufaily et al. (2012) o il metodo LR-CUSUM negativo binomiale descritto in Höhle e Paul (2008). È anche incluso un approccio CUSUM innovativo che combina modellazione logistica e logistica multinomiale. Inoltre sono forniti metodi di inferenza per i modelli retrospettivi di malattie infettive contenuti in Held et al. (2005), Held et al. (2006), Paul et al. (2008), Paul e Held (2011), Held e Paul (2012), e Meyer e Held (2014).

I processi puntuali spazio-temporali autoeccitanti continui sono modellati attraverso intensità condizionali additive-moltiplicative, come descritto in Höhle (2009) ("twinSIR", spazio discreto) e Meyer et al. (2012) ("twinstim", spazio continuo).

Il pacchetto contiene svariati insiemi di dati reali, la capacità di simulare dati di epidemie, visualizzare i risultati del monitoraggio in maniera temporale, spaziale o spazio-temporale.

Nota: l'uso dell'algoritmo "boda" richiede il pacchetto "INLA" che è disponibile da <http://www.r-inla.org/download>.

Tags: Field: Medicine, Implemented in: GNU R, User Interface: interface::commandline, role::program

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