Package: trinityrnaseq-examples (2.11.0+dfsg-6)

[ Source: trinityrnaseq  ]

file comuni di esempio e di test per assemblati de novo di RNA-Seq

Trinity rappresenta un metodo innovativo per una ricostruzione de novo efficiente e robusta di trascrittomi da dati di RNA-seq. Trinity combina tre moduli software indipendenti: Inchworm, Chrysalis e Butterfly, applicati sequenzialmente per elaborare grandi volumi di letture di RNA-seq. Trinity partiziona i dati delle sequenze in molti grafi de Bruijn individuali, ciascuno dei quali rappresenta la complessità trascrizionale ad un dato gene o locus, e poi elabora ciascun grafo indipendentemente per estrarre isoforme di splicing a lunghezza intera e per separare i trascritti derivati da geni paraloghi.

Questo pacchetto contiene file di test e d'esempio.

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