Package: sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Source: sniffles  ]

strumento per identificare varianti strutturali usando sequenziamento di terza generazione

Sniffles è uno strumento per identificare varianti strutturali (SV) usando dati di sequenziamento di terza generazione come quelli delle piattaforme Pacific Biosciences o Oxford Nanopore. Rileva tutti i tipi di SV usando allineamenti di letture divise, regioni con elevata non corrispondenza e analisi di copertura come indizi.

Other Packages Related to sniffles

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  libreria dinamica per manipolare file BAM (allineamento di genoma)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Download sniffles

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	703.3 kB	1,100.0 kB	[list of files]
arm64	681.9 kB	1,040.0 kB	[list of files]
armel	674.2 kB	1,027.0 kB	[list of files]
armhf	680.5 kB	899.0 kB	[list of files]
i386	717.0 kB	1,127.0 kB	[list of files]
mips64el	680.8 kB	1,166.0 kB	[list of files]
mipsel	682.9 kB	1,147.0 kB	[list of files]
ppc64el	707.2 kB	1,196.0 kB	[list of files]
s390x	679.3 kB	1,100.0 kB	[list of files]