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Package: rampler (2.0.0-1)

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modulo per campionare sequenze genomiche

Modulo autonomo per il campionamento di sequenze genomiche. Gestisce due modalità: sottocampionamento casuale di dati di sequenziamento ad una profondità desiderata (data la lunghezza di riferimento) e suddivisione di file ad una dimensione desiderata in byte.

Rampler prende come primo argomento di input un file in formato FASTA/FASTQ che può essere compresso con gzip. Il resto dei parametri di input dipende dalla modalità di funzionamento. L'output è memorizzato in uno o più file che sono nello stesso formato del file di input ma non compressi.

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