Package: msxpertsuite (5.8.9-1)

[ Source: msxpertsuite  ]

suite software per spettrometria di massa - metapacchetto

msXpertSuite fornisce programmi per modellare la chimica dei (bio-)polimeri lineari, simulare dati di spettrometria di massa, analizzare e fare data-mining sulla massa. È l'erede di GNU polyXmass, prima, e poi di massXpert.

I programmi massXpert e mineXpert permettono quanto segue:

massXpert:

 - creare definizioni chimiche di polimeri completamente nuove;
 - usare le definizioni per eseguire facili calcoli in maniera simile
   a una calcolatrice da tavolo;
 - eseguire sofisticate modifiche e simulazioni su sequenze polimeriche;
 - eseguire confronti di elenchi m/z.

Le simulazioni chimiche comprendono scissione (chimica o enzimatica), frammentazioni gas-fase, modifiche chimiche di qualsiasi monomero nella sequenza polimerica, collegamenti incrociati di monomeri nella sequenza, ricerche arbitrarie di massa, calcoli del modello isotopico...

mineXpert:

 - file di dati open mass spectrometry (mzML, mzXML, asc, xy, ...);
 - calcolo e visualizzazione di cromatogrammi TIC;
 - per dati di mobilità, calcolo e visualizzazione di una mappa mz=f(dt)
   a colori;
 - integrazione dei dati dal cromatogramma TIC o dalla mappa a colori
   - allo spettro di massa,
   - allo spettro del drift;
   - di nuovo al cromatogramma TIC (cromatogramma XIC);
   - operazioni inverse;
   - al singolo valore di intensità TIC
     (per confronti di intensità degli spettri di massa);
 - modellare i picchi dei centroidi in uno spettro di massa usando il
   modello gaussiano o il modello lorentziano;
 - esportare i dati in file di testo;
 - dividere un grande file iniziale in pezzi più piccoli per un mining
   più facile;
 - definire come l'attività di mining è registrata su disco per un uso
   successivo;
 - convertire file mzML in un formato di spettrometria privato (ma aperto)
   che permette prestazioni migliori (basato su SQLite3).

Questo pacchetto dipende sia dal pacchetto di massXpert sia da quello di mineXpert e perciò li installerà entrambi. Per installare solo uno dei pacchetti, si installi il corrispondente pacchetto, msxpertsuite-massxpert o msxpertsuite-minexpert.

Tags: Interface Toolkit: Qt

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