Package: gmap (2021-02-22+ds-1)

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Similar packages:

allineamento tollerante agli SNP e con splicing per mRNA e letture corte

Questo pacchetto contiene i programmi GMAP e GSNAP, oltre ad utilità per gestire database di genomi in formato GMAP/GSNAP. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) è uno strumento per allineare sequenze di EST, mRNA e cDNA. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) è uno strumento per allineare letture di trascrittoma a terminali singoli e appaiati. Entrambi gli strumenti possono usare un database di:

 * siti di splicing noti e identificare nuovi siti di splice;
 * polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) noti.

GSNAP può allineare DNA trattato con bisolfito.

Tags: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

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dep: libbz2-1.0

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also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: perl

"Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	11,332.0 kB	86,543.0 kB	[list of files]
arm64	6,976.6 kB	57,915.0 kB	[list of files]
armel	5,605.3 kB	43,621.0 kB	[list of files]
armhf	5,756.4 kB	41,853.0 kB	[list of files]
i386	5,907.0 kB	43,773.0 kB	[list of files]
mips64el	5,324.5 kB	54,666.0 kB	[list of files]
mipsel	5,291.6 kB	45,235.0 kB	[list of files]
ppc64el	7,219.0 kB	60,727.0 kB	[list of files]