Package: freebayes (1.3.5-1)

[ Source: freebayes  ]

scoperta e genotipizzazione bayesiana di polimorfismo basati su aplotipi

FreeBayes è un rilevatore bayesiano di varianti genetiche progettato per trovare piccoli polimorfismi, specificamente SNP (single-nucleotide polymorphism), indel (inserzioni e delezioni), MNP (multi-nucleotide polymorphism) ed eventi complessi (eventi di sostituzione e inserzione compositi) più piccoli della lunghezza di un allineamento di sequenziamento di letture corte.

Other Packages Related to freebayes

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.2+dfsg)

  libreria C++ per analizzare e manipolare file VCF

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• rec: parallel

  crea ed esegue righe di comando dallo standard input in parallelo

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,433.4 kB	3,949.0 kB	[list of files]
arm64	1,385.5 kB	3,805.0 kB	[list of files]
armel	1,367.9 kB	3,789.0 kB	[list of files]
armhf	1,377.7 kB	3,417.0 kB	[list of files]
i386	1,480.3 kB	4,153.0 kB	[list of files]
mips64el	1,420.4 kB	4,291.0 kB	[list of files]
mipsel	1,444.5 kB	4,292.0 kB	[list of files]
ppc64el	1,452.5 kB	4,254.0 kB	[list of files]
s390x	1,366.8 kB	4,028.0 kB	[list of files]