Package: disulfinder (1.2.11-10)

[ Source: disulfinder  ]

predittore della connettività e stato di legame del ponte disulfuro di cisteine

"disulfinder" serve a predire, a partire dalla sola sequenza, lo stato di legame con ponti disolfuro di cisteine e la loro connettività con ponte disolfuro. I ponti disolfuro hanno un ruolo importante nella stabilizzazione del processo di ripiegamento per molte proteine. La predizione di ponti disolfuro dalla sola sequenza è perciò utile per lo studio delle proprietà strutturali e funzionali di specifiche proteine. In aggiunta, la conoscenza dello stato di legame dei ponti disolfuro delle cisteine può aiutare il processo di determinazione sperimentale della struttura e può essere utile in altre attività di annotazione genomica.

"disulfinder" predice i modelli di ponti disolfuro in due passi di calcolo: (1) viene predetto lo stato di legame con ponte disolfuro di ciascuna cisteina usando un classificatore binario BRNN-SVM; (2) le cisteine di cui si sa che partecipano a formare ponti vengono accoppiate da una rete neurale ricorsiva per ottenere un modello di connettività.

Tags: Role: Program

Other Packages Related to disulfinder

• dep: disulfinder-data

  file dei dati per il predittore di ponti disulfuro in proteine

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

Download disulfinder

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	233.3 kB	684.0 kB	[list of files]
arm64	199.7 kB	592.0 kB	[list of files]
armel	185.7 kB	567.0 kB	[list of files]
armhf	191.4 kB	411.0 kB	[list of files]
i386	241.3 kB	703.0 kB	[list of files]
mips64el	203.9 kB	739.0 kB	[list of files]
mipsel	204.0 kB	725.0 kB	[list of files]
ppc64el	234.4 kB	764.0 kB	[list of files]
s390x	203.7 kB	676.0 kB	[list of files]