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inferenza filogenetica bayesiana MCMC

BEAST è un programma multipiattaforma per l'analisi bayesiana MCMC di sequenze molecolari. È interamente orientato verso filogenie con radici, misurate nel tempo e inferite usando modelli di orologio rigidi o rilassati. Può essere usato come un metodo di ricostruzione di filogenie ma è anche un'infrastruttura per testare ipotesi evolutive senza condizionamento su una singola topologia dell'albero. BEAST usa MCMC per mediare sullo spazio dell'albero, in modo che ogni albero sia pesato proporzionalmente alla sua probabilità a posteriori. È incluso un programma con un'interfaccia utente semplice da usare per impostare analisi standard e una suite di programmi per analizzare i risultati.

Questa non è una nuova versione a monte di beast-mcmc (1.x), ma piuttosto una versione riscritta.

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