Package: fastqc (0.11.9+dfsg-4)

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Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Olivier Sallou (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.bioinformatics.babraham.ac.uk]

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controllo di qualità per elevati flussi di dati di sequenze

FastQC mira a fornire un metodo rapido per effettuare alcuni controlli di qualità su elevati flussi attraverso pipe di dati di sequenze grezzi. Fornisce un insieme modulare di analisi che consentono di avere una veloce panoramica sui dati per individuare eventuali presenze di errori o problemi che bisogna tenere in considerazione prima di utilizzarli in analisi successive.

Le funzioni principali di FastQC sono:

 * importazione di dati da file BAM, SAM o FastQ (qualsiasi variante);
 * rapida panoramica per identificare in quali aree potrebbero esserci
   problemi;
 * grafici e tabelle riepilogative per una valutazione rapida dei dati;
 * esportazione dei risultati in un report permanente in formato HTML;
 * modalità offline che consente la generazione di report automatici senza
   eseguire l'applicazione interattiva.

Tags: User Interface: Graphical User Interface, X Window System, Role: Program

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libreria per compressione/decompressione bzip2
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libreria HDF facile da usare per Java

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