[ Source: ampliconnoise ]
Package: ampliconnoise (1.29-9)
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Debian Resources:
Download Source Package ampliconnoise:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Tim Booth (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Pranav Ballaney (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
rimozione di rumore da ampliconi PCR sequenziati con 454
AmpliconNoise è un pacchetto di applicazioni per ripulire dati di sequenziamento ad alte prestazioni. Consiste di tre parti principali:
Pyronoise - esegue clustering basato su flowgram per individuare letture errate; SeqNoise - rimuove mutazioni puntuali PCR; Perseus - rimuove chimere PCR senza la necessità di un insieme di sequenze di riferimento.
Precedentemente esisteva un "Pyronoise" autonomo degli stessi autori e questo pacchetto include una versione aggiornata. C'è anche un "Denoiser" in Qiime che è collegato, ma distinto.
Other Packages Related to ampliconnoise
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgsl25 (>= 2.6)
- GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.4)
- libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa
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- dep: mafft
- programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche
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- rec: openmpi-bin
- libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni -- binari
Download ampliconnoise
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| s390x | 1,073.6 kB | 2,012.0 kB | [list of files] |