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Package: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2)

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allineamenti multipli di proteine con appaiamento di sequenze

AMAP è uno strumento a riga di comando per effettuare allineamenti multipli di sequenze peptidiche. Utilizza il metodo di decodifica a posteriori e allineamenti per appaiamenti di sequenze, invece del tradizionale metodo di allineamento progressivo. È l'unico programma di allineamento che permette di controllare il rapporto sensibilità/specificità. È basato sul codice sorgente di ProbCons, ma usa una precisione per le misurazioni degli allineamenti ed elimina le trasformazioni per coerenza.

Lo strumento di visualizzazione Java di AMAP 2.2 non è ancora disponibile come pacchetto Debian.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

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