Package: probalign (1.4-9)

[ Source: probalign  ]

allineamento di sequenze multiple usando le probabilità a posteriori della funzione di ripartizione

Probalign usa stime della probabilità a posteriori della funzione di ripartizione per calcolare allineamenti di sequenze multiple con la massima accuratezza attesa. Funziona in modo migliore rispetto ai programmi di allineamento più usati Probcons v1.1, MAFFT v5.851 e MUSCLE v3.6 nei test di prestazione BAliBASE 3.0, HOMSTRAD e OXBENCH, e tale miglioramento è statisticamente significativo. I miglioramenti di Probalign sono maggiori negli insiemi di dati che contengono estensioni terminali N/C e in quelli con sequenze di lunghezze elevate ed eterogenee. Negli insiemi di dati con lunghezze eterogenee contenenti ripetizioni, l'accuratezza degli allineamenti di Probalign è del 10% e il 15% maggiore rispetto agli altri tre metodi, quando la deviazione standard della lunghezza è almeno 300 e 400.

Other Packages Related to probalign

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, ppc64el]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	65.5 kB	172.0 kB	[list of files]
arm64	63.0 kB	152.0 kB	[list of files]
armel	55.6 kB	143.0 kB	[list of files]
armhf	54.6 kB	115.0 kB	[list of files]
i386	62.0 kB	159.0 kB	[list of files]
mips64el	67.3 kB	176.0 kB	[list of files]
mipsel	64.6 kB	170.0 kB	[list of files]
ppc64el	76.9 kB	220.0 kB	[list of files]
s390x	58.2 kB	172.0 kB	[list of files]