Package: libbio-samtools-perl (1.43-3 and others)

[ Source: libbio-samtools-perl  ]

interfaccia Perl alla libreria SamTools per sequenziamento di DNA

Bio::SamTools fornisce un'interfaccia Perl alla libreria libbam per database di allineamenti di sequenze SAM/BAM indicizzati e non indicizzati. Fornisce il supporto per il recupero di informazioni su allineamenti singoli, coppie di letture e informazioni sulla copertura degli allineamenti su grandi regioni. Fornisce anche funzionalità di callback per rilevare SNP ed effettuare altre funzioni base-per-base. La maggior parte delle operazioni è compatibile con l'interfaccia BioPerl Bio::SeqFeatureI, permettendo di utilizzare file BAM come backend per l'applicazione per navigazione di genomi GBrowse.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library, Shared Library

Other Packages Related to libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  moduli Perl centrali di BioPerl

• dep: libc6 (>= 2.15) [not arm64, ppc64el]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

• dep: perl (>= 5.32.0-4)

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

• dep: perlapi-5.32.0

  virtual package provided by perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

• enh: gbrowse

  browser generico per genoma di GMOD

• enh: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Download libbio-samtools-perl

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.43-3+b1	194.0 kB	625.0 kB	[list of files]
arm64	1.43-3+b1	184.1 kB	609.0 kB	[list of files]
armel	1.43-3+b1	177.8 kB	598.0 kB	[list of files]
armhf	1.43-3+b1	177.7 kB	490.0 kB	[list of files]
i386	1.43-3+b1	205.7 kB	689.0 kB	[list of files]
mips64el	1.43-3+b1	181.3 kB	682.0 kB	[list of files]
mipsel	1.43-3+b1	183.9 kB	682.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.43-3+b1	204.0 kB	821.0 kB	[list of files]
s390x	1.43-3+b1	184.3 kB	669.0 kB	[list of files]