Package: garli-mpi (2.1-4)

[ Source: garli  ]

analisi filogenetica di dati di sequenze molecolari usando la massima verosimiglianza (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference, è un programma per inferire alberi filogenetici. Usando un approccio simile a un algoritmo genetico classico, cerca rapidamente nello spazio degli alberi evoluzionistici e dei parametri dei modelli per trovare la soluzione che massimizza il punteggio di verosimiglianza. Implementa modelli di evoluzione di sequenze basati su codoni, amminoacidi e nucleotidi e funziona su tutte le piattaforme. L'ultima versione aggiunge la gestione di modelli partizionati e tipi di dati tipo morfologia.

Questa versione di Garli usa MPI.

Other Packages Related to garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20190531.feceb81) [not amd64]

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]

• dep: openmpi-bin

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni -- binari

Download garli-mpi

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	599.4 kB	1,640.0 kB	[list of files]
arm64	545.6 kB	1,420.0 kB	[list of files]
armel	489.5 kB	1,307.0 kB	[list of files]
armhf	466.8 kB	907.0 kB	[list of files]
i386	530.1 kB	1,523.0 kB	[list of files]
mips64el	585.7 kB	1,816.0 kB	[list of files]
mipsel	585.2 kB	1,732.0 kB	[list of files]
ppc64el	668.3 kB	1,812.0 kB	[list of files]
s390x	490.4 kB	1,572.0 kB	[list of files]