Package: r-cran-ape (5.7-1)

[ Source: r-cran-ape  ]

pacchetto GNU R per analisi su filogenesi ed evoluzione

Questo pacchetto fornisce funzioni per leggere, scrivere, disegnare e manipolare alberi filogenetici, analisi di dati comparativi in un'infrastruttura filogenetica, analisi di caratteri ancestrali, analisi di diversificazione e macroevoluzione, calcoli di distanze da sequenze di DNA, lettura e scrittura di sequenze nucleotidiche oltre all'importazione da BioConductor e svariati strumenti come il test di Mantel, grafici skyline generalizzati, esplorazioni grafiche di dati filogenetici (alex, trex, kronoviz), stime di tassi evolutivi assoluti e alberi in stile orologio usando lunghezze di percorsi medi e verosimiglianza con penalità, traduzione di DNA in sequenze di AA e valutazione di allineamenti di sequenze. Le stime filogenetiche possono essere fatte con i metodi NJ, BIONJ, ME, MVR, SDM e triangolare e svariati metodi gestiscono matrici di distanze non complete (NJ*, BIONJ*, MVR* e il corrispondente metodo triangolare). Alcune funzioni chiamano applicazioni esterne (PhyML, Clustal, T-Coffee, Muscle) i cui risultati vengono restituiti ad R.

Tags: Software Development: GNU R Development, Field: Statistics, Implemented in: GNU R

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,816.0 kB	3,661.0 kB	[list of files]
arm64	2,801.1 kB	3,649.0 kB	[list of files]
armel	2,795.2 kB	3,627.0 kB	[list of files]
armhf	2,796.5 kB	3,551.0 kB	[list of files]
i386	2,828.4 kB	3,705.0 kB	[list of files]
mips64el	2,807.8 kB	3,728.0 kB	[list of files]
mipsel	2,805.9 kB	3,721.0 kB	[list of files]
ppc64el	2,824.0 kB	3,777.0 kB	[list of files]
s390x	2,809.5 kB	3,677.0 kB	[list of files]