Package: r-bioc-genomicfiles (1.34.0-1)

[ Source: r-bioc-genomicfiles  ]

Distributed computing by file or by range

This package provides infrastructure for parallel computations distributed 'by file' or 'by range'. User defined MAPPER and REDUCER functions provide added flexibility for data combination and manipulation.

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  virtual package provided by r-base-core

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• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

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  funzioni generiche per Bioconductor

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• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.7.7)

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• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.16)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-matrixgenerics

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• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.29)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.25.3)

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.27.9)

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• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biostrings

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• sug: r-bioc-genefilter

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• sug: r-bioc-snpstats

  classi e metodi SnpMatrix e XSnpMatrix per BioConductor

• sug: r-cran-runit

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