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Paquet : velvet (1.2.03~nozlibcopy-1)

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assembleur de séquences d'acides nucléiques pour de très courtes lectures

Velvet est un assembleur génomique de type de novo (assemblage de lectures courtes pour créer des séquences de pleine longueur) spécialement conçu pour les technologies de séquençage à lecture courte, telles que Solexa de l'entreprise Illumina ou 454 de l'entreprise Roche, développées par Daniel Zerbino et Ewan Birney au centre de recherche European Bioinformatics Institute (EBI) qui fait partie du European Molecular Biology Laboratory (EMBL), proche de Cambridge, au Royaume-Uni .

Le logiciel Velvet prend actuellement des séquences de lectures courtes, enlève les erreurs puis produit des contigs uniques de haute qualité. Il utilise alors les informations de lecture des paires, si elles sont disponibles, pour extraire les zones répétées entre les contigs.

Étiquettes: Biologie: Acides nucléiques, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: role::program, use::analysing

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armhf 679,3 ko2 017,0 ko [liste des fichiers]
i386 679,2 ko2 168,0 ko [liste des fichiers]
ia64 796,8 ko3 569,0 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 673,8 ko2 013,0 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 681,1 ko2 070,0 ko [liste des fichiers]
mips 665,1 ko2 224,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 666,2 ko2 225,0 ko [liste des fichiers]
powerpc 661,0 ko2 136,0 ko [liste des fichiers]
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sparc 684,5 ko2 267,0 ko [liste des fichiers]