all options
squeeze  ] [  wheezy  ] [  jessie  ] [  stretch  ] [  sid  ]
[ Source: velvet  ]

Package: velvet (1.2.03~nozlibcopy-1)

Links for velvet

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package velvet:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

assembleur de séquences d'acides nucléiques pour de très courtes lectures

Velvet est un assembleur génomique de type de novo (assemblage de lectures courtes pour créer des séquences de pleine longueur) spécialement conçu pour les technologies de séquençage à lecture courte, telles que Solexa de l'entreprise Illumina ou 454 de l'entreprise Roche, développées par Daniel Zerbino et Ewan Birney au centre de recherche European Bioinformatics Institute (EBI) qui fait partie du European Molecular Biology Laboratory (EMBL), proche de Cambridge, au Royaume-Uni .

Le logiciel Velvet prend actuellement des séquences de lectures courtes, enlève les erreurs puis produit des contigs uniques de haute qualité. Il utilise alors les informations de lecture des paires, si elles sont disponibles, pour extraire les zones répétées entre les contigs.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing

Other Packages Related to velvet

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download velvet

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 674.9 kB2,106.0 kB [list of files]
armel 675.5 kB2,215.0 kB [list of files]
armhf 679.3 kB2,017.0 kB [list of files]
i386 679.2 kB2,168.0 kB [list of files]
ia64 796.8 kB3,569.0 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 673.8 kB2,013.0 kB [list of files]
kfreebsd-i386 681.1 kB2,070.0 kB [list of files]
mips 665.1 kB2,224.0 kB [list of files]
mipsel 666.2 kB2,225.0 kB [list of files]
powerpc 661.0 kB2,136.0 kB [list of files]
s390 673.2 kB2,206.0 kB [list of files]
s390x 671.4 kB2,197.0 kB [list of files]
sparc 684.5 kB2,267.0 kB [list of files]