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Paquet : cd-hit (4.6-2012-04-25-1)

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suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences

cd-hit contient un certain nombre de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences. cd-hit groupe les protéines en grappes qui satisfont à un seuil de similitudes défini par l'utilisateur. cd-hit-est est similaire à cd-hit, mais conçu pour grouper des séquences (sans introns). cd-hit-est-2d est similaire à cd-hit-2d mais conçu pour comparer 2 ensembles de données de nucléotides. Un certain nombre d'autres programmes associés sont aussi dans ce paquet. De plus amples informations se trouvent dans le manuel utilisateur de cd-hit, qui se trouve dans ce paquet.

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