toutes les options
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Paquet source : zalign  ]

Paquet : zalign (0.9.1-2 et autres)

Liens pour zalign

Screenshot

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source zalign :

Responsables :

Ressources externes :

Paquets similaires :

alignement parallèle local de séquences biologiques

zAlign est un aligneur local de séquences, spécialement conçu pour de grosses séquences d'ADN biologique, avec plus de 1Mdp (millions de paires de base). Il utilise l'algorithme exact Smith-Waterman avec une fonction affine « gap cost » pour cette tâche.

zAlign peut être utilisé dans des environnements simples ou distribués (dans des grappes par exemple). Il est actuellement testé sous Linux et Sun Solaris, en utilisant les implémentations MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) et OpenMPI (http://www.open-mpi.org/). Des portages vers d'autres environnements Unix sont envisagés.

Autres paquets associés à zalign

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances

Télécharger zalign

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 0.9.1-2+b3 47,4 ko266,0 ko [liste des fichiers]
arm64 0.9.1-2+b3 45,0 ko266,0 ko [liste des fichiers]
armel 0.9.1-2+b3 26,1 ko118,0 ko [liste des fichiers]
armhf 0.9.1-2+b3 26,8 ko102,0 ko [liste des fichiers]
i386 0.9.1-2+b3 48,2 ko256,0 ko [liste des fichiers]
mips 0.9.1-2+b3 49,0 ko319,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 0.9.1-2+b3 51,5 ko559,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 0.9.1-2+b3 50,0 ko319,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 0.9.1-2+b3 48,4 ko418,0 ko [liste des fichiers]
s390x 0.9.1-2+b3 46,6 ko306,0 ko [liste des fichiers]