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Paquet : amap-align (2.2-1)

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Alignement multiple de séquences protéiques par appariement

AMAP est un outil en ligne de commande pour effectuer des alignements multiples de séquences peptidiques. Il utilise le décodage a posteriori, et l'alignement par appariement de séquence, au lieu de la méthode traditionnelle d'alignement progressif. C'est le seul programme permettant le contrôle de la sensibilité et de la spécificité. Il est basé sur le code source de ProbCons mais utilise une métrique de précision et élimine la transformation de cohérence.

L'outil java de visualisation de AMAP 2.2 n'est pas encore disponible en paquets Debian.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: C++, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: Analyse, Comparaison, Format pris en charge: Texte simple

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