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Paquet : mafft (6.815-1)

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Paquets similaires :

programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

MAFFT est un programme d'alignement multiple de séquences qui offre trois méthodes orientées précision : - L-INS-i : probablement la plus précise ; recommandée pour moins de

   200 séquences ; méthode de raffinement itératif qui incorpore les
   informations d'alignement des paires locales ;
- G-INS-i : convient pour des séquences de longueurs similaires ;
   recommandée pour moins de 200 séquences ; méthode de raffinement
   itératif qui incorpore les informations d'alignement des paires
   globales ;
- E-INS-i : convient pour des séquences qui contiennent de grandes régions
   non-alignables ; recommandée pour moins de 200 séquences.
   MAFFT fournit également cinq méthodes orientées vitesse :
 - FFT-NS-i : méthode de raffinement itératif de deux cycles seulement ;
 - FFT-NS-i : méthode de raffinement itératif d'un maximum de 1 000
itérations ;
 - FFT-NS-2 : rapide, méthode progressive ;
 - FFT-NS-1 : très rapide, recommandé pour plus de 2 000 séquences ;
    méthode progressive avec un arbre de recherche grossier ;
 - NW-NS-PartTree-1 : recommandé pour environ 50 000 séquences ; méthode
    progressive avec l'algorithme PartTree.

Étiquettes: Biologie: Clustal et ALN, biology::format:fasta, Acides nucléiques, Protéines, Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: Comparaison, Format pris en charge: Texte simple

Autres paquets associés à mafft

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 3 154,8 ko7 096,0 ko [liste des fichiers]
armel 2 931,0 ko6 480,0 ko [liste des fichiers]
i386 2 296,7 ko5 636,0 ko [liste des fichiers]
ia64 4 950,6 ko16 128,0 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 3 154,7 ko7 422,0 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 2 296,6 ko5 704,0 ko [liste des fichiers]
mips 2 986,5 ko7 768,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 2 997,4 ko7 768,0 ko [liste des fichiers]
powerpc 2 882,2 ko6 476,0 ko [liste des fichiers]
s390 2 692,5 ko6 204,0 ko [liste des fichiers]
sparc 2 620,3 ko5 980,0 ko [liste des fichiers]