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Paquets similaires :

read SAM/BAM nucleotide sequence aligment database files

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Étiquettes: Développement de logiciel: Programmation Perl, Bibliothèques, Mis en œuvre en: C, Perl, Rôle: Bibliothèque partagée

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