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processeur d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM

Samtools est un ensemble d'utilitaires qui manipulent les alignements de séquence de nucléotides dans le format binaire BAM. Il est capable d'importer et d'exporter à partir du format SAM (« Sequence Alignment/Map »), de trier, de fusionner, d'indexer et de récupérer des enregistrements dans n'importe quelle région facilement. Il est conçu pour travailler sur un flux de données et est capable d'ouvrir un fichier BAM (mais pas SAM) sur un serveur HTTP ou FTP distant.

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