Paquet source : bioperl-run (1.7.3-10)
Liens pour bioperl-run
Ressources Debian :
Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- bioperl-run
- scripts d'enveloppe BioPerl
- libbio-perl-run-perl
- modules d'enveloppe BioPerl
Autres paquets associés à bioperl-run
-
- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Paquet indisponible
-
- adep:
libmodule-build-perl
- framework for building and installing Perl modules
-
- idep:
perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
-
- idep:
bioperl
(>= 1.7.4)
- outils en Perl pour la bio-informatique
-
- idep:
libalgorithm-diff-perl
- module pour trouver des différences entre des fichiers
-
- idep:
libipc-run-perl
- module de Perl pour l’exécution de programme
-
- idep:
libio-string-perl
- Emulate IO::File interface for in-core strings
-
- idep:
libxml-twig-perl
- Perl module for processing huge XML documents in tree mode
-
- idep:
libfile-sort-perl
- module to sort a file or merge sort multiple files
-
- idep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
-
- idep:
libarray-compare-perl
- module Perl pour comparer facilement des tableaux
-
- idep:
libtree-dagnode-perl
- Perl (super)class for representing nodes in a tree
-
- idep:
libbio-cluster-perl
- BioPerl cluster modules
-
- idep:
libbio-featureio-perl
- Modules for reading, writing, and manipulating sequence features
-
- idep:
libconfig-any-perl
- module to load configuration from different file formats
-
- idep:
libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl
[any-amd64]
- Bioperl interface to Clustal W
-
- idep:
libbio-eutilities-perl
- interface BioPerl pour les Entrez Programming Utilities (E-utilities)
-
- idep:
libbio-tools-run-remoteblast-perl
- Object for remote execution of the NCBI Blast via HTTP
-
- idep:
amap-align
- alignement multiple de séquences protéiques par appariement
-
- idep:
bedtools
[any-amd64]
- suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes
-
- idep:
bedtools-test
- données de test pour le paquet bedtools
-
- idep:
ncbi-blast+-legacy
- script d’appel de legacy de BLAST du NCBI
-
- idep:
clustalw
[any-amd64]
- alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
-
- idep:
emboss
- ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
-
- idep:
exonerate
- outil générique pour la comparaison de deux séquences
-
- idep:
hmmer
[any-amd64 any-i386 powerpc ppc64]
- profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
-
- idep:
hyphy-pt
- Hypothesis testing using Phylogenies (pthreads version)
- ou
hyphy-mpi
[any-amd64]
- Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)
-
- idep:
infernal
[any-amd64 any-i386]
- inférence d’alignements structurels secondaires d’ARN
-
- idep:
kalign
- Alignement séquentiel multiple global et progressif
-
- idep:
mafft
- programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
-
- idep:
muscle
- programme d'alignements multiples de séquences de protéine
-
- idep:
ncoils
- prédiction de structure secondaire de superhélice
-
- idep:
phyml
- estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale
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- idep:
primer3
- outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN
-
- idep:
probcons
- alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
-
- idep:
python3-pybedtools
[any-amd64]
- enveloppe de Python 3 pour BEDTools pour des tâches de bio-informatique
-
- idep:
raxml
- ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
-
- idep:
samtools
[any-amd64]
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
-
- idep:
sim4
- Outil d'alignement d'ADNc et d'ADN génomique
-
- idep:
tigr-glimmer
- Détection de gènes dans des archées et des bactéries
-
- idep:
wise
- comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines
-
- idep:
fasttree
- arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines
-
- idep:
lagan
- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
-
- idep:
pal2nal
- converts proteins to genomic DNA alignment
-
- idep:
pftools
[any-amd64]
- build and search protein and DNA generalized profiles
-
- idep:
libwww-perl
- interface simple et cohérente au world-wide web
