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[ Paquet source : seqtools  ]

Paquet : belvu (4.44.1+dfsg-3)

Liens pour belvu

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Ressources Debian :

Télécharger le paquet source seqtools :

Responsables :

Ressources externes :

Paquets similaires :

visualisateur d’alignements de séquences multiples et outil phylogénétique

Belvu est un est un visualisateur d’alignements de séquences multiples et un outil phylogénétique avec un grand ensemble de modes personnalisables de coloration de résidus.

 – vue d’alignements de séquences multiples ;
 – coloration des résidus selon la conservation, avec des seuils et
   couleurs personnalisables ;
 – coloration des résidus selon les types (personnalisables) ;
 – schémas de couleur importables ou exportables ;
 – récupération des inscriptions de Swissprot (ou PIR) par double clic ;
 – suivi aisé de la position dans l’alignement ;
 – suppression manuelle de lignes et colonnes ;
 – édition automatique de lignes et colonnes, basée sur des critères
   personnalisables :
    — suppression de toutes les colonnes avec trous,
    — suppression de tous les trous,
    — suppression de toutes les séquences redondantes,
    — suppression d’une colonne selon un pourcentage personnalisable
      de trous,
    — filtrage de séquences selon le pourcentage d’identités,
    — suppression de séquences selon un pourcentage personnalisable
      de trous,
    — suppression de séquences incomplètes (celles commençant ou finissant
      par des trous,
    — suppression de colonnes par conservation (avec des seuils hauts et
      bas personnalisables) ;
 – enregistrement des alignements aux formats Stockholm, Selex, MSF
   ou FASTA ;
 – matrices de distances entre séquences créées en utilisant différentes
   métriques de distance ;
 – matrices de distances importables ou exportables ;
 – construction d’arbres phylogénétiques basée sur différents algorithmes
   de reconstruction d’arbre basés sur la distance ;
 – enregistrement des arbres au format New Hampshire ;
 – reconstruction phylogénétique par technique « bootstrap ».

Étiquettes: Boîte à outils d'interface utilisateur: GTK

Paquets fournissant belvu

acedb-other-belvu
paquet de transition pour belvu

Autres paquets associés à belvu

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances

Télécharger belvu

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha (portage non officiel) 202,6 ko460,0 ko [liste des fichiers]
amd64 197,1 ko396,0 ko [liste des fichiers]
arm64 188,7 ko388,0 ko [liste des fichiers]
armel 180,3 ko343,0 ko [liste des fichiers]
armhf 181,0 ko295,0 ko [liste des fichiers]
hppa (portage non officiel) 196,1 ko386,0 ko [liste des fichiers]
i386 206,4 ko427,0 ko [liste des fichiers]
m68k (portage non officiel) 197,1 ko407,0 ko [liste des fichiers]
mips 200,6 ko458,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 201,3 ko482,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 202,3 ko458,0 ko [liste des fichiers]
powerpcspe (portage non officiel) 195,3 ko439,0 ko [liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel) 205,1 ko504,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 204,9 ko504,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 (portage non officiel) 191,9 ko351,0 ko [liste des fichiers]
s390x 188,4 ko412,0 ko [liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel) 210,9 ko388,0 ko [liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel) 183,5 ko397,0 ko [liste des fichiers]
x32 (portage non officiel) 197,3 ko371,0 ko [liste des fichiers]