Paquet : tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-9 et autres)

[ Paquet source : tree-puzzle  ]

Reconstruction d'arbres phylogéniques par ressemblance maximum

TREE-PUZZLE (le nouveau nom pour PUZZLE) est un programme interactif en console qui intègre un algorithme rapide de recherche par arborescence, sur 4 niveaux, qui permet l'analyse de grands jeux de données et qui fournit un support d'estimations à chaque branche interne. TREE-PUZZLE calcule aussi des distances maximales entre des paires semblables, ainsi que la longueur des branches spécifiées par les utilisateurs. Les branches peuvent aussi être calculées durant un temps donné. De plus, TREE-PUZZLE offre une nouvelle méthode, la cartographie par similitude, pour rechercher le support d'une hypothétique branche interne sans calculer l'arbre complet et pour visualiser l'enchaînement d'un alignement de séquence apparentées.

Ceci est la version parallélisée de tree-puzzle.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::analysing, use::comparing, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• rec: tree-puzzle-doc

  reconstruction d’arbres phylogénétiques par la vraisemblance maximale – documentation

• sug: phylip

  paquet de programmes pour déduire les phylogénies

• sug: treetool

  Paquet indisponible

Télécharger tree-ppuzzle

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	181,6 ko	557,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	5.3~rc16+dfsg-9+b1	181,5 ko	433,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	5.3~rc16+dfsg-9+b1	164,6 ko	428,0 ko	[liste des fichiers]
armel	5.3~rc16+dfsg-9+b1	174,2 ko	448,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	5.3~rc16+dfsg-9+b1	165,2 ko	332,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	172,1 ko	437,0 ko	[liste des fichiers]
i386	5.3~rc16+dfsg-9+b1	193,8 ko	532,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	233,7 ko	860,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	165,7 ko	452,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-9+b1	180,0 ko	511,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	193,5 ko	557,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-9+b1	191,6 ko	557,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-9+b2	182,2 ko	377,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	5.3~rc16+dfsg-9+b1	193,7 ko	484,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	196,8 ko	429,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	166,6 ko	1 071,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	177,3 ko	416,0 ko	[liste des fichiers]