Paquet : plastimatch (1.9.4+dfsg.1-2 et autres)

[ Paquet source : plastimatch  ]

reconstruction d’images médicales et recalage

Plastimatch est un logiciel au code source ouvert pour le recalage d’images fluctuantes (« deformable »). Il est conçu pour un enregistrement volumétrique de haute performance d’images médicales, telles que scanographie, imagerie par résonance magnétique (IRM) ou tomoscintigraphie par émission de positons (TEP). Les propriétés du logiciel sont :

 — méthode « B-spline » pour le recalage d’images fluctuantes (accélérations
     graphique GPU et multi-cœur), y compris le masquage d’image, « landmark
     penalties » et régularisation ;
 — méthode « Demons » pour l’enregistrement d’images fluctuantes (accélération
     graphique GPU) ;
 — segmentation multi-atlas ;
 — algorithmes basés sur ITK pour les multiples méthodes de translation,
     rigides, affines, démons multiples, et enregistrement « B-spline z ;
 — cadriciel d’enregistrement multi-étape parallélisé avec une conversion
     homogène entre la plupart des algorithmes et les types de transformation ;
 — enregistrement d’images fluctuantes en fonction de repères en utilisant
     des splines de fines tranches pour un enregistrement global ;
 — enregistrement d’images fluctuantes en fonction de repères en utilisant
     des fonctions basiques en utilisant des fonctions basiques radiales ;
 — vaste prise en charge des formats de fichier d’image 3D (avec ITK),
     intégrant DICOM, Nifti, NRRD, MetaImage et Analyze ;
 — chaîne d’outils extensibles pour la recherche en radiothérapie, comprenant
     la prise en charge des formats de fichier DICOM, DICOM-RT, DICOM SRO et
     XiO, l’analyse gamma, les manipulations de contour, l’analyse des
     recoupements et l’analyse des champs de vecteurs ;

Plastimatch prend aussi en charge deux utilitaires pratiques qui ne concernent pas directement le recalage d’image :

 — reconstruction FDK cone-beam CT (accélérations graphique GPU et
     multi-cœur) ;
 — génération de radiographies reconstruites de manière numérique
     (accélérations graphique GPU et multi-cœur).

Étiquettes: Domaine: Médecine, Imagerie médicale, Interface utilisateur: interface::graphical, interface::x11, Rôle: Programme, But: Visualisation de données, Système X Window: Application

Autres paquets associés à plastimatch

• dep: libblas3 [amd64]

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64]

  dep: libc6 (>= 2.35) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libdcmtk17t64 (>= 3.6.7) [amd64]

  bibliothèques d'exécution pour la boîte à outils OFFIS DICOM

• dep: libdcmtk2 (>= 3.6.0) [non amd64]

  Paquet indisponible

• dep: libdlib19.1t64 (>= 19.24+dfsg) [amd64]

  C++ toolkit for machine learning and computer vision - library

• dep: libfftw3-double3 [non amd64]

  bibliothèque de calcul des transformées de Fourier rapides — double précision

  dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.10) [amd64]

• dep: libfftw3-single3 [hppa, ppc64]

  bibliothèque de calcul des transformées de Fourier rapides — simple précision

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [non amd64, hppa]

  Paquet indisponible

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Paquet indisponible

• dep: libgdcm2.2 [ppc64]

  Paquet indisponible

• dep: libgdcm2.4 [non amd64, ppc64]

  Grassroots DICOM runtime libraries

• dep: libgomp1 (>= 4.4) [ppc64]

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

  dep: libgomp1 (>= 4.9) [non ppc64]

• dep: libinsighttoolkit3.20 [non amd64]

  Paquet indisponible

• dep: libinsighttoolkit5.3 (>= 5.3.0) [amd64]

  boîte à outils de traitement d'images pour le recalage et la segmentation - bibliothèques dynamiques

• dep: liblapack3 [amd64]

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

  ou liblapack.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libpng12-0 (>= 1.2.13-4) [ppc64]

  Paquet indisponible

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 4.6) [ppc64]

  dep: libstdc++6 (>= 4.9) [non amd64, ppc64]

• dep: libtiff5 (>= 4.0.3) [ppc64]

  Paquet indisponible

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ppc64]

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger plastimatch

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.6.0+dfsg-1	2 809,2 ko	19 192,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.9.4+dfsg.1-2+b1	2 862,8 ko	16 368,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.6.2+dfsg-1	2 632,8 ko	15 912,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.5.15+dfsg-1	4 736,4 ko	73 800,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.6.2+dfsg-1	2 011,9 ko	14 081,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.6.2+dfsg-1	2 470,8 ko	13 292,0 ko	[liste des fichiers]