Paquet : embassy-domainatrix (0.1.660-5 et autres)

[ Paquet source : embassy-domainatrix  ]

commandes supplémentaires EMBOSS pour manipuler un fichier de classification de domaines

Les logiciels DOMAINATRIX ont été développés par Jon Ison et ses collègues pour le projet HGMP (« Human Genome Mapping Project » − projet de cartographie du génome humain) au Medical Research Council (MRC) en Angleterre, pour leurs recherches dans le domaine de la protéine. Ils sont inclus dans un paquet embassy comme un travail en cours.

Les logiciels de la publication actuelle de domainatrix sont :

 - cathparse : crée un fichier DCF à partir de fichiers bruts CATH ;
 - domainnr : supprime les domaines redondants d'un fichier DCF ;
 - domainreso : supprime les domaines à faible résolution d'un fichier
    DCF ;
 - domainseqs : ajoute des enregistrements de séquences à un fichier DCF ;
 - domainsse : ajoute des enregistrements de structure secondaire à un
    fichier DCF ;
 - scopparse : crée un fichier DCF à partir de fichiers bruts SCOP ;
 - ssematch : parcourt un fichier DCF à la recherche de correspondances de
    la structure secondaire.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, Ensemble d'application: suite::TODO, use::analysing, But: Conversion de données, Édition, use::searching, works-with-format::TODO, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à embassy-domainatrix

• dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

  EMBOSS Libraries

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0+dfsg)

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libx11-6

  bibliothèque X11 partie client

• rec: emboss

  ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

• sug: embassy

  Paquet indisponible

Télécharger embassy-domainatrix

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.1.660-5	59,8 ko	850,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.1.660-5	60,4 ko	510,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.1.660-5	59,5 ko	850,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.1.660-4	61,0 ko	465,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.1.660-5	63,9 ko	495,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.1.660-4	61,5 ko	476,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.1.660-5	60,0 ko	853,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.1.660-5	61,5 ko	850,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.1.660-5	61,3 ko	850,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.1.660-5	59,0 ko	470,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.1.660-4	62,7 ko	460,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.1.660-5	60,4 ko	7 576,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.1.660-4	61,4 ko	496,0 ko	[liste des fichiers]