Paquet : ampliconnoise (1.29-11 et autres)

[ Paquet source : ampliconnoise  ]

suppression du bruit pour les amplicons PCR séquencés 454

AmpliconNoise est un ensemble d'applications pour nettoyer les données de séquences haute fréquence. Il est constitué de trois parties principales :  

 - Pyronnoise : rassemble les mauvais points en se basant sur un
    diagramme de flux ;
 - SeqNoise : enlève les mutations de point PCR ;
 - Perseus : enlève les chimères PCR sans avoir besoin d'un ensemble de
    séquences de références.

Étiquettes: Rôle: Programme

Autres paquets associés à ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2) [x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [non x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• rec: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Télécharger ampliconnoise

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.29-11	1 073,8 ko	2 525,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.29-11	1 086,3 ko	2 037,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.29-11	1 075,1 ko	2 397,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.29-11	1 066,5 ko	1 956,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.29-11	1 061,5 ko	1 824,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.29-11	1 062,8 ko	1 925,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.29-11	1 077,3 ko	2 000,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.29-11	1 096,8 ko	2 314,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.29-11	1 060,0 ko	1 928,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.29-11	1 072,6 ko	2 419,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.29-11	1 089,0 ko	2 589,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.29-11	1 094,5 ko	2 589,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.29-11	1 082,4 ko	1 905,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.29-11	1 098,1 ko	2 085,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.29-11	1 094,3 ko	2 384,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.29-11	1 065,6 ko	14 888,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.29-10+b1	1 081,3 ko	1 988,0 ko	[liste des fichiers]