[ Paquet source : mapdamage ]
Paquet : mapdamage (2.2.1+dfsg-3)
Liens pour mapdamage
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source mapdamage :
- [mapdamage_2.2.1+dfsg-3.dsc]
- [mapdamage_2.2.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [mapdamage_2.2.1+dfsg-3.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [ginolhac.github.io]
Paquets similaires :
tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences
MapDamage is a computational framework written in Python and R, which tracks and quantifies DNA damage patterns among ancient DNA sequencing reads generated by Next-Generation Sequencing platforms.
MapDamage is developed at the Centre for GeoGenetics by the Orlando Group.
Autres paquets associés à mapdamage
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- dep: libopenblas-dev
- Optimized BLAS (linear algebra) library (dev, meta)
- ou libblas-dev
- Basic Linear Algebra Subroutines 3, bibliothèque statique
- ou libatlas-base-dev
- Automatically Tuned Linear Algebra Software — bibliothèques génériques statiques
- ou libblas.so
- paquet virtuel fourni par libatlas-base-dev, libblas-dev, libblis-openmp-dev, libblis-pthread-dev, libblis-serial-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev
-
- dep: libopenblas-dev
- Optimized BLAS (linear algebra) library (dev, meta)
- ou liblapack-dev
- bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version statique
- ou libatlas-base-dev
- Automatically Tuned Linear Algebra Software — bibliothèques génériques statiques
- ou liblapack.so
- paquet virtuel fourni par libatlas-base-dev, liblapack-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev
-
- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: r-base-core
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
-
- dep: r-cran-gam
- modèle additif généralisé (GAM) pour R
-
- dep: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- dep: r-cran-inline
- paquet de GNU R pour « inline » des fonctions de C, C++ et Fortran à partir de R
-
- dep: r-cran-rcpp
- GNU R package for Seamless R and C++ Integration
-
- dep: r-cran-rcppgsl
- GNU R package for integration with the GNU GSL
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- dep: seqtk
- Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format
Télécharger mapdamage
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 40,9 ko | 190,0 ko | [liste des fichiers] |