Paquet : fastaq (3.17.0-6)

[ Paquet source : fastaq  ]

outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ

Fastaq est une collection variée de scripts qui réalisent des tâches utiles et courantes de manipulation pour FASTA et FASTQ, telles que le filtrage, la fusion, le fractionnement, le découpage, la recherche ou le remplacement, etc. Les fichiers d’entrée et de sortie peuvent être compressés (le format est automatiquement détecté) et les différentes commandes de Fastaq peuvent être redirigées (pipe).

Étiquettes: Biologie: Fasta/Pearson, Acides nucléiques, Domaine: field::biology, field::biology:bioinformatics, Mis en œuvre en: implemented-in::python, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::analysing, use::calculating, Vérification, Conversion de données, use::filtering, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à fastaq

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-pkg-resources

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: samtools

  traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	46,4 ko	195,0 ko	[liste des fichiers]