Paquet : blasr (5.3.5+dfsg-6 et autres)

[ Paquet source : blasr  ]

correspondance de lectures de séquençage de molécules simples

BLASR (« Basic local alignment with successive refinement ») est une méthode pour mettre en correspondance des lectures de séquençage de molécules simples avec un génome de référence. De telles lectures sont longues de plusieurs milliers de bases et les divergences entre elles et le génome sont dominées par les erreurs d'insertion et de suppression.

Autres paquets associés à blasr

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg)

  outils pour l'alignement de lectures PacBio sur des séquences cibles

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg)

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~)

  library for analyzing PacBio sequencing data

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64	5.3.5+dfsg-6+b1	216,3 ko	528,0 ko	[liste des fichiers]