Paquet : autogrid (4.2.6-9 et autres)

[ Paquet source : autodocksuite  ]

Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur

AutoDockSuite permet l'analyse de l'amarrage de molécules de faible poids moléculaire à des récepteurs dont la structure tri-dimensionnelle est connue.

Le programme AutoGrid crée les grilles calculées en prévision de l'amarrage moléculaire de ligands à des grilles qui décrivent l'effet de l'environnement créé par la protéine sur des sondes moléculaires ponctuelles, chargées ou non, permettant de décrire les différents types d'interactions intermoléculaires ligand-protéine (charges positives, négatives, liaisons hydrogènes accepteur, liaisons hydrogènes donneur, hydrophobe, aliphatique, ...). L'effet de ces forces est ensuite analysé avec le programme AutoDock.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Biologie structurale, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::analysing, works-with-format::TODO, Fonctionne avec: Maquette en trois dimensions

Autres paquets associés à autogrid

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• sug: autodock

  Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine

• enh: autodock

  Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64	4.2.6-9+b1	45,3 ko	96,0 ko	[liste des fichiers]